| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 29 | ハラ トモヒロ 原 知寛 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 4:59.42 | |
| 2 | 30 | マツナガ シュンヤ 松永 隼弥 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:14.09 | |
| 3 | 357 | デグチ キョウスケ 出口 峡介 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:15.58 | |
| 4 | 493 | カワグチ ケイイチロウ 川口圭一郎 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:22.43 | |
| 5 | 99 | ホンダ マサヒロ 本田 雅浩 (5) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 5:25.85 | |
| 6 | 31 | ワタナベ コウキ 渡辺 昂希 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:33.08 | |
| 7 | 348 | タハラ カケル 田原 翔 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:34.47 | |
| 8 | 194 | カワゴ レオ 川後 怜央 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 5:35.27 | |
| 9 | 22 | イケダ ヒカル 池田 輝 (5) | ナガヨミナミ 長与南 | 5:35.75 | |
| 10 | 198 | ヤマシタ コウシロウ 山下光志朗 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 5:36.65 | |
| 11 | 23 | ミヤザキ カイリ 宮崎 海里 (5) | ナガヨミナミ 長与南 | 5:37.91 | |
| 12 | 195 | ナガノ リンタ 永野 凜太 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 5:40.93 | |
| 13 | 196 | ミヤワキ ケイタ 宮脇 圭太 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 5:41.99 | |
| 14 | 318 | ヤマモト キヨト 山本 清人 (5) | ナガタＪＣ 長田JC | 5:42.59 | |
| 15 | 115 | トリス ソウイチロウ 鳥巣総一朗 (5) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 5:43.13 | |
| 16 | 227 | ナガタ タクミ 永田 拓巳 (5) | ヒガシナガサキＪＣ 東長崎JC | 5:44.07 | |
| 17 | 375 | オオカワ ギンガ 大川 銀雅 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 5:53.15 | |
| 18 | 475 | ヨシミ トモキ 吉見 智貴 (5) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 5:57.89 | |
| 19 | 373 | サイトウ ミタカ 齋藤 海貴 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 5:59.84 | |
| 20 | 199 | タサキ ソウマ 田﨑 颯真 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 6:01.99 | |
| 21 | 197 | マツシタ セイリュウ 松下 征龍 (5) | ナナツガマＪＣ 七釜JC | 6:06.83 | |
| 22 | 350 | ミズモト ハヤト 水本 颯 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 6:11.65 | |
| 23 | 372 | フクダ セイヤ 福田 晟也 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:12.62 | |
| 24 | 24 | シゲヤマ フウタ 茂山 歩詩 (5) | ナガヨミナミ 長与南 | 6:14.23 | |
| 25 | 374 | トクナガ ソウタ 徳永 颯太 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:17.99 |