| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 38 | ヤマサキ ショウタロウ 山崎将大朗 (5) | ナガヨミナミ 長与南 | 5:11.38 | |
| 2 | 417 | ワタナベ カケル 渡邊 翔 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:18.20 | |
| 3 | 253 | エグチ ケイ 江口 葵 (5) | ヒガシナガサキＪＣ 東長崎JC | 5:22.15 | |
| 4 | 254 | カワチ リュウセイ 川内 琉生 (5) | ヒガシナガサキＪＣ 東長崎JC | 5:23.22 | |
| 5 | 48 | ヨシダ ホマレ 吉田 誉 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:25.24 | |
| 6 | 46 | ヒラ タイヨウ 平 太陽 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:27.88 | |
| 7 | 44 | イシダ ユウマ 石田 裕真 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:38.85 | |
| 8 | 416 | シマ タカト 島 崇心 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:41.22 | |
| 9 | 45 | ウメゾノ ワタル 梅園 渉 (5) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 5:44.56 | |
| 10 | 94 | ナカムラ ユウト 中村 悠人 (5) | トギツジャック 時津ＪＡＣ | 5:49.45 | |
| 11 | 648 | ウエノ シュウヤ 上野 周哉 (5) | ヒガシナガサキＪＣ 東長崎JC | 5:54.19 | |
| 12 | 96 | シバヤマ ヒカル 柴山 大輝 (5) | トギツジャック 時津ＪＡＣ | 5:58.60 | |
| 13 | 415 | ムカイ ナオ 向井 直央 (5) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:59.73 | |
| 14 | 606 | ハタ シュオン 秦 秀音 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:02.12 | |
| 15 | 656 | ニシヤマ イブキ 西山 依吹 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:03.45 | |
| 16 | 88 | イマヅミ ケン 今積 健 (5) | トギツジャック 時津ＪＡＣ | 6:05.43 | |
| 17 | 607 | ヤマダ ユメナリ 山田 夢也 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:27.58 | |
| 18 | 181 | エシタ ユウダイ 江下 湧大 (5) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 6:32.58 | |
| 19 | 93 | ソトヒラ ケイタ 外平 景大 (5) | トギツジャック 時津ＪＡＣ | 6:34.86 | |
| 20 | 608 | イワマツ リョウスケ 岩松 椋祐 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 6:54.82 | |
| 21 | 157 | コイケ ヨウタ 小池 陽大 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 7:20.98 | |
| 22 | 156 | モリ タイキ 森 大輝 (5) | キタイサハヤ 北諫早 | 7:31.16 |