| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3715 | ハマダ リュウト 濵田 隆人 (6) | SC東彼杵 | 5:12.61 | |
| 2 | 41 | ヤマサキ ショウタロウ 山崎将大朗 (6) | 長与南 | 5:13.55 | |
| 3 | 436 | ヤナイ ケンジ 柳井 健司 (5) | 南部AC | 5:15.66 | |
| 4 | 349 | アワムラ イッサ 阿波村一佐 (5) | 長崎陸上ク | 5:20.88 | |
| 5 | 435 | ヤマネ コウセイ 山根 晃静 (6) | 南部AC | 5:22.65 | |
| 6 | 332 | マツムラ コウキ 松村 剛輝 (5) | 松村AC | 5:29.85 | |
| 7 | 430 | ササハラ イツキ 佐々原 樹 (5) | 南部AC | 5:30.54 | |
| 8 | 403 | ヒサタ ユウダイ 久田 優泰 (6) | 大村陸上ク | 5:35.02 | |
| 9 | 432 | ヨシダ コウ 吉田 紘 (6) | 南部AC | 5:39.09 | |
| 10 | 486 | ホンダ ヒサシ 本多 寿志 (6) | 梅谷SC | 5:41.20 | |
| 11 | 331 | ミウラ マヒロ 三浦 眞尋 (5) | 松村AC | 5:41.63 | |
| 12 | 347 | ナカムラ タダト 中村 一登 (5) | 長崎陸上ク | 5:46.45 | |
| 13 | 434 | ヒラシタ ヤマト 平下 倭 (6) | 南部AC | 5:46.48 | |
| 14 | 29 | ニシヤマ イブキ 西山 依吹 (6) | 北諫早 | 5:49.31 | |
| 15 | 431 | ミヤウチ ユウジ 宮内 裕二 (5) | 南部AC | 5:59.18 | |
| 16 | 410 | ミヤザキ リク 宮嵜 陸 (5) | 大村陸上ク | 6:02.67 | |
| 17 | 3712 | ウツノミヤ イラク 宇都宮湧楽 (5) | 南部AC | 6:07.89 | |
| 18 | 488 | ナガトモ シオン 永友 志穏 (5) | 梅谷SC | 6:07.94 | |
| 19 | 206 | ミヤジマ ユイト 宮島 唯人 (5) | ISAHAYA Jr | 6:14.46 | |
| 20 | 172 | マツオ タケキ 松尾 勇輝 (6) | 長田JC | 6:17.01 | |
| 21 | 34 | ソノカワ リョウマ 園川 凌真 (5) | 北諫早 | 6:17.77 | |
| 22 | 408 | ミヨシ リョウガ 三芳 崚雅 (5) | 大村陸上ク | 6:23.03 | |
| 23 | 409 | ミヤザキ ダイチ 宮嵜 大地 (5) | 大村陸上ク | 6:31.13 | |
| 24 | 203 | コガ ジン 古賀 仁 (5) | ISAHAYA Jr | 6:33.77 | |
| 25 | 474 | エグチ ユキヒデ 江口 幸秀 (5) | 松村AC | 6:49.38 | |
| 26 | 170 | オオタケ タイセイ 大嶽 太誠 (5) | 長田JC | 6:55.13 | |
| 27 | 173 | イシカワ マサト 石川 真人 (6) | 長田JC | 6:55.17 | |
| 28 | 171 | イワサキ コウヨウ 岩崎 公陽 (6) | 長田JC | 7:07.86 | |
| 29 | 487 | アラキ タカヒロ 荒木 隆弘 (5) | 梅谷SC | 7:12.09 |