| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 36 | マスダ アキラ 増田 瑛 (6) | 長与南 | 5:16.60 | |
| 2 | 38 | ヤマサキ ショウタロウ 山崎将大朗 (5) | 長与南 | 5:19.17 | |
| 3 | 165 | モリ アヤト 森 文人 (5) | ＭＪＣ | 5:29.84 | |
| 4 | 485 | マツオ ユウキ 松尾 優輝 (6) | 梅谷SC | 5:34.64 | |
| 5 | 431 | イワオ カズキ 岩尾 和樹 (5) | 南部AC | 5:37.55 | |
| 6 | 486 | カワグチ リオ 川口 凜央 (5) | 梅谷SC | 5:50.71 | |
| 7 | 430 | ヨシダ ナオ 吉田 直生 (6) | 南部AC | 5:58.00 | |
| 8 | 174 | イノウエ コウキ 井上 航凞 (6) | 長崎陸上ク | 6:02.71 | |
| 9 | 175 | ヒラオカ カズノリ 平岡 和徳 (6) | 長崎陸上ク | 6:03.67 | |
| 10 | 434 | ヒラシタ ヤマト 平下 倭 (5) | 南部AC | 6:06.37 | |
| 11 | 370 | シンドウ レオ 進藤 玲音 (6) | 北串クラブ | 6:32.08 | |
| 12 | 344 | テツヤ シュンスケ 鉄屋 俊輔 (5) | ISAHAYA Jr | 6:32.73 | |
| 13 | 346 | スギヤマ アユム 杉山 歩 (5) | ISAHAYA Jr | 7:57.16 | |
| 14 | 345 | タカノ ミズキ 高野 海輝 (5) | ISAHAYA Jr | 8:07.84 |