| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 538 | コウノ ケイタ 河野 圭汰 (4) | マツムラエーシー 松村AC | 3:22.01 | |
| 2 | 188 | アハムラ イチサ 阿波村一佐 (4) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 3:32.46 | |
| 3 | 541 | マツムラ コウキ 松村 剛輝 (4) | マツムラエーシー 松村AC | 3:34.97 | |
| 4 | 49 | マツナガ ユウマ 松永 有真 (4) | ムラマツクラブ 村松クラブ | 3:35.14 | |
| 5 | 186 | ナカムラ タダト 中村 一登 (4) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 3:37.03 | |
| 6 | 259 | ホンダ ライト 本多 来斗 (4) | ヒガシナガサキＪＣ 東長崎JC | 3:42.95 | |
| 7 | 167 | トウモト ヒロム 東本 大夢 (4) | エムジェイシー ＭＪＣ | 3:43.01 | |
| 8 | 418 | ハマ レオン 濱 黎苑 (4) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 3:51.26 | |
| 9 | 597 | カメカワ トモヤ 亀川 友哉 (4) | ナガサキリクジョウク 長崎陸上ク | 3:53.53 | |
| 10 | 161 | ソノカワ リョウマ 園川 凌真 (4) | キタイサハヤ 北諫早 | 4:03.94 | |
| 11 | 159 | マキ ムネユキ 牧 宗幸 (4) | キタイサハヤ 北諫早 | 4:09.74 | |
| 12 | 162 | ウスキ ダイゴ 臼木 大悟 (4) | キタイサハヤ 北諫早 | 4:19.52 | |
| 13 | 494 | ソノダ テツヤ 園田 哲也 (4) | キタイサハヤ 北諫早 | 4:20.04 | |
| 14 | 419 | ヤタケ カズト 矢竹 一翔 (4) | メイホウジュニア 明峰Ｊ | 5:01.69 |