| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | カワハラ リュウト 川原 琉人 (6) | 川原ＪＣ | 4:56.17 | |
| 2 | 331 | ヒサタ カナト 久田 叶翔 (6) | 大村陸上ク | 5:01.22 | |
| 3 | 408 | オノウエ レン 尾上 蓮 (6) | 南部AC | 5:20.62 | |
| 4 | 375 | ミズグチ ホウタロウ 水口鳳太郎 (6) | 明峰Ｊ | 5:23.16 | |
| 5 | 411 | シバハラ シュウト 柴原 秀斗 (5) | 南部AC | 5:26.54 | |
| 6 | 382 | イノウエ ユウタ 井上 裕太 (6) | 明峰Ｊ | 5:28.28 | |
| 7 | 330 | ヤマネ ダイト 山根 大翔 (6) | 大村陸上ク | 5:28.76 | |
| 8 | 409 | ナガオ ケンシン 長尾 剣心 (6) | 南部AC | 5:35.93 | |
| 9 | 383 | アラキ ヤマト 荒木 大翔 (6) | 梅谷SC | 5:36.92 | |
| 10 | 384 | ナカノ ソウタ 中野 颯太 (6) | 梅谷SC | 5:36.98 | |
| 11 | 227 | ババ ケイセイ 馬場 啓成 (6) | 北串クラブ | 5:37.58 | |
| 12 | 412 | ヤスダ コウガ 安田 虎雅 (5) | 南部AC | 5:42.77 | |
| 13 | 49 | ムタ ソウタ 牟田 颯太 (5) | ＭＪＣ | 5:45.44 | |
| 14 | 110 | マキザワ コウセイ 巻澤 滉星 (6) | 北諫早 | 5:46.17 | |
| 15 | 50 | ムタ リンタ 牟田 凜太 (5) | ＭＪＣ | 5:50.22 | |
| 16 | 46 | ヒグチ ユウヤ 樋口 雄哉 (6) | ＭＪＣ | 5:53.19 | |
| 17 | 385 | マツオ ユウマ 松尾 悠真 (6) | 梅谷SC | 5:57.85 | |
| 18 | 372 | トクナガ マヒロ 徳永 誠大 (6) | 明峰Ｊ | 5:58.72 | |
| 19 | 373 | オオイシ ミズキ 大石 瑞貴 (6) | 明峰Ｊ | 6:01.40 | |
| 20 | 113 | ナカヤマ ハジメ 中山 一 (5) | 北諫早 | 6:01.71 | |
| 21 | 410 | キド ハクト 木戸 珀斗 (6) | 南部AC | 6:02.50 | |
| 22 | 335 | カワノ アキトシ 河野 彰駿 (6) | 大村陸上ク | 6:06.89 | |
| 23 | 388 | アラキ コウキ 荒木 光輝 (5) | 梅谷SC | 6:09.77 | |
| 24 | 272 | モリ ユウゴ 森 優悟 (5) | SC東彼杵 | 6:12.00 | |
| 25 | 47 | タニグチ レイ 谷口 黎 (6) | ＭＪＣ | 6:12.76 | |
| 26 | 487 | ナカムラ ソウシ 中村 壮志 (5) | 真津山RC | 6:18.37 | |
| 27 | 337 | サカタ トモユキ 坂田 友幸 (6) | 大村陸上ク | 6:26.15 | |
| 28 | 269 | タキガワ タイキ 滝川 泰輝 (6) | SC東彼杵 | 6:38.89 |