| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 245 | カキモト キオン 柿本 騎音 (6) | 大瀬戸JC | 5:02.18 | |
| 2 | 397 | クロダ ソラト 黒田 空飛 (6) | 大村陸上ク | 5:02.71 | |
| 3 | 311 | クロキ リョウマ 黒木 凌真 (6) | 東長崎JC | 5:03.74 | |
| 4 | 41 | シバヤマ カナメ 柴山 叶夢 (6) | 時津クラブ | 5:11.67 | |
| 5 | 400 | クチイシ リョウ 口石 諒 (6) | 大村陸上ク | 5:12.12 | |
| 6 | 213 | トジマ ハヤト 冨嶋 颯音 (6) | 七釜JC | 5:22.84 | |
| 7 | 42 | ヤマグチ ハルヤ 山口 遥椰 (6) | 時津クラブ | 5:28.31 | |
| 8 | 173 | カシヤマ ナル 樫山 鳴 (6) | 北諫早 | 5:32.67 | |
| 9 | 175 | ナカヤマ ハジメ 中山 一 (6) | 北諫早 | 5:46.75 | |
| 10 | 40 | アサクラ コウタ 朝倉 洸太 (6) | 時津クラブ | 6:05.00 | |
| 11 | 225 | ハシモト リュウタ 橋本 龍太 (6) | スマイル | 0. | |
| 11 | 385 | モチダ ソウスケ 用田 宗佑 (6) | 明峰Ｊ | 0. | |
| 11 | 399 | ナカ ハルト 中 遥翔 (6) | 大村陸上ク | 0. |