| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 440 | ツルタ タカヒロ 鶴田 宇大 (5) | 南部AC | 2:41.69 | |
| 2 | 36 | ハマサキ ダイゴ 濵﨑 大悟 (5) | 村松クラブ | 2:41.86 | |
| 3 | 190 | カワハラ アユム 河原 歩夢 (5) | 長崎陸上ク | 2:46.84 | |
| 4 | 35 | ナガオカ ハルミチ 長岡 春道 (5) | 村松クラブ | 2:49.46 | |
| 5 | 441 | ヤマグチ ハヤテ 山口 颯爽 (5) | 南部AC | 2:54.53 | |
| 6 | 442 | タカヒラ イオリ 高比良 庵 (5) | 南部AC | 2:55.32 | |
| 7 | 13 | ツノダ リョウタ 津野田凌太 (5) | 長与クラブ | 2:56.20 | |
| 8 | 14 | ヨシダ ケイゴ 吉田 圭吾 (5) | 長与クラブ | 2:56.87 | |
| 9 | 15 | オバタ ユウキ 尾畑 勇気 (5) | 長与クラブ | 2:58.77 | |
| 10 | 131 | マツオ キョウゴ 松尾 享悟 (5) | 洗切クラブ | 3:04.07 | |
| 11 | 134 | セトグチ リョウ 瀬戸口 諒 (5) | 洗切クラブ | 3:06.17 | |
| 12 | 34 | イワタ ヒュウゴ 岩田 彪冴 (5) | 村松クラブ | 3:08.93 | |
| 13 | 187 | タナベ コウダイ 田邊 航大 (5) | 長崎陸上ク | 3:11.26 | |
| 14 | 132 | モリ マオ 森 真王 (5) | 洗切クラブ | 3:13.09 | |
| 15 | 133 | コイワ ショウヘイ 小岩 昇平 (5) | 洗切クラブ | 3:14.45 | |
| 16 | 230 | ナカヤマ エイショウ 中山 瑛照 (5) | 高田小 | 3:19.88 | |
| 17 | 443 | オノウエ コウガ 尾上 煌河 (5) | 南部AC | 3:21.70 | |
| 18 | 188 | ヤノ リョウタ 矢野 涼太 (5) | 長崎陸上ク | 3:25.08 | |
| 19 | 16 | ヤマグチ ユウト 山口 悠斗 (5) | 長与クラブ | 3:28.24 | |
| 20 | 189 | イデ エイタロウ 井手瑛太郎 (5) | 長崎陸上ク | 3:33.10 | |
| 21 | 186 | ササダ ハルノブ 笹田 悠信 (5) | 長崎陸上ク | 3:33.17 |