| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3501 | タナカ シュウジ 田中 柊士 (3) | 長崎大附属 | 4:18.26 | |
| 2 | 3002 | カワチ リュウセイ 川内 琉生 (3) | 橘 | 4:19.86 | |
| 3 | 107 | マイグマ カンタ 毎熊 完太 (3) | 東長崎 | 4:25.17 | |
| 4 | 3001 | イデ ヨウタ 井手 陽太 (3) | 橘 | 4:26.87 | |
| 5 | 3502 | イワオ カズキ 岩尾 和樹 (3) | 長崎大附属 | 4:29.71 | |
| 6 | 108 | イタクラ タクマ 板倉 琢馬 (3) | 東長崎 | 4:33.73 | |
| 7 | 2910 | タナカ レンタロウ 田中廉太朗 (3) | 小江原 | 4:39.53 | |
| 8 | 2303 | マワタリ ショウ 馬渡 匠 (3) | 西浦上 | 4:40.48 | |
| 9 | 1305 | ヤマネ コウセイ 山根 晃静 (3) | 戸町 | 4:41.57 | |
| 10 | 2201 | ヤマグチ テッペイ 山口 哲平 (3) | 岩屋 | 4:47.69 | |
| 11 | 1303 | ミヤガミ ヒナタ 宮上 陽向 (3) | 戸町 | 4:47.80 | |
| 12 | 2606 | ムラカミ タクミ 村上 匠 (3) | 滑石 | 4:48.27 | |
| 13 | 2904 | ニシカワ ショウヤ 西川 晶也 (3) | 小江原 | 4:49.06 | |
| 14 | 1706 | ヒラシタ ヤマト 平下 倭 (3) | 福田 | 5:19.84 | |
| 1704 | タバタ サスケ 田端 咲介 (3) | 福田 | DNS | ||
| 2801 | ユラ コウシン 由良 晃心 (3) | 横尾 | DNS | ||
| 2601 | クマベ ユウシ 隈部 勇史 (3) | 滑石 | DNS |