| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3502 | ツノマチ ユメリ 角町友芽梨 (3) | 長崎大附属 | 4:42.36 | |
| 2 | 3404 | ハマゾエ カホ 濵添 花穂 (3) | 琴海 | 4:54.42 | |
| 3 | 111 | マツモト ワカナ 松本わかな (2) | 東長崎 | 5:02.99 | |
| 4 | 1407 | イワサキ コトリ 岩﨑ことり (1) | 土井首 | 5:13.41 | |
| 5 | 3301 | ハギハラ マリナ 萩原真理菜 (2) | 三和 | 5:14.87 | |
| 6 | 3510 | イワナガ リコ 岩永 莉子 (2) | 長崎大附属 | 5:15.89 | |
| 7 | 3405 | ハマモト サクラ 濵本さくら (3) | 琴海 | 5:19.82 | |
| 8 | 2001 | ミヤザキ ジュンナ 宮﨑 純凪 (3) | 淵 | 5:22.33 | |
| 9 | 112 | カワマ カエデ 河間 楓 (2) | 東長崎 | 5:25.23 | |
| 10 | 301 | アラキ シノ 荒木 志乃 (3) | 桜馬場 | 5:26.90 | |
| 11 | 4502 | ツツミ ヒビキ 堤 響生 (2) | 長崎東 | 5:30.11 | |
| 12 | 302 | マエサキ ミユウ 前崎 実優 (3) | 桜馬場 | 5:43.00 | |
| 13 | 1405 | ヒラツジ キララ 平辻 姫月 (2) | 土井首 | 5:54.70 | |
| 14 | 1901 | サトウ ユイ 佐藤 優衣 (2) | 丸尾 | 6:11.85 | |
| 2215 | ウエハラ ユイ 上原 結衣 (2) | 岩屋 | DNS |