| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 456 | ヨネミツ フウマ 米満 楓馬 (4) | 明峰Ｊ | 3:21.11 | |
| 2 | 404 | エグチ ユウ 江口 優 (4) | 大村陸上ク | 3:28.75 | |
| 3 | 406 | モトムラ ユウヤ 本村 優也 (4) | 大村陸上ク | 3:30.46 | |
| 4 | 403 | ワタナベ トア 渡辺 翔愛 (4) | 大村陸上ク | 3:47.99 | |
| 5 | 310 | ナカシマ タカラ 中島 宝良 (4) | SC東彼杵 | 3:53.64 | |
| 6 | 640 | ヤマモト コタロウ 山本虎太郎 (4) | 時津クラブ | 3:53.99 | |
| 7 | 187 | マツモト ユウシ 松本 侑志 (4) | 北諫早 | 4:00.66 | |
| 8 | 41 | オオツボ カナト 大坪 奏仁 (4) | 時津クラブ | 4:02.96 | |
| 9 | 454 | テラダ ナオキ 寺田 直樹 (4) | 明峰Ｊ | 4:03.05 | |
| 10 | 185 | ホンダ ユウタロウ 本田悠太郎 (4) | 北諫早 | 4:13.34 | |
| 11 | 571 | ヨシカワ ヒロト 吉川 大翔 (4) | 東長崎JC | 4:18.85 | |
| 12 | 592 | ナカヤマ シュウゴ 中山 柊吾 (4) | 時津クラブ | 4:24.75 | |
| 13 | 43 | フルカワ ショウタ 古川 匠太 (4) | 時津クラブ | 4:57.48 |