| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 439 | キド カイシュウ 木戸 海秀 (5) | 南部AC | 2:37.50 | |
| 2 | 19 | カモガワ カズキ 鴨川 和生 (5) | 長与クラブ | 2:39.09 | |
| 3 | 27 | ナカマツ ユキト 仲松優希斗 (5) | 長与クラブ | 2:45.35 | |
| 4 | 123 | フクダ ノブキ 福田 遥己 (5) | 洗切クラブ | 2:46.39 | |
| 5 | 23 | セガワ サクタロウ 瀬川朔太郎 (5) | 長与クラブ | 2:55.42 | |
| 6 | 122 | ハヤマ タカハル 葉山 陽春 (5) | 洗切クラブ | 2:55.69 | |
| 7 | 26 | タカラダ ヨシヒト 寶田 吉仁 (5) | 長与クラブ | 3:00.76 | |
| 8 | 25 | スギモト タケト 杉本 武翔 (5) | 長与クラブ | 3:01.87 | |
| 9 | 440 | イワサキ シュン 岩崎 瞬 (5) | 南部AC | 3:04.18 | |
| 10 | 145 | モリタ ウミ 森田 海 (5) | 長崎陸上ク | 3:04.94 | |
| 11 | 144 | ホリエ ヒロキ 堀江 浩喜 (5) | 長崎陸上ク | 3:05.70 | |
| 12 | 141 | イチノミヤ ソウシ 一宮 奏志 (5) | 長崎陸上ク | 3:20.61 | |
| 13 | 140 | タチ カズシ 田地 和志 (5) | 長崎陸上ク | 3:27.72 |