| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | イリハマ キヒロ 入濵 輝大 (1) | 瓊浦 | 15:49.07 | |
| 2 | 66 | ヒラオカ カズノリ 平岡 和徳 (2) | 瓊浦 | 15:56.93 | |
| 3 | 2056 | フクモト ユウキ 福本 雄貴 | 長崎市陸協 | 16:01.33 | |
| 4 | 2088 | ワシオ ユウイチ 鷲尾 優一 | 南部AC | 16:14.86 | |
| 5 | 954 | カワラダ ユウタロウ 瓦田雄太郎 (3) | 長崎東 | 16:28.54 | |
| 6 | 985 | マツモト ケイジロウ 松本慧次郎 (3) | 長崎西 | 16:36.37 | |
| 7 | 991 | シモガマ ユウキ 下釜 悠暉 (2) | 長崎西 | 16:46.65 | |
| 8 | 825 | ニノミヤ マサト 二宮 正人 (3) | 長崎北 | 16:52.72 | |
| 9 | 2057 | モトムラ ケンタ 本村 健太 | 長崎市陸協 | 16:55.17 | |
| 10 | 976 | コンドウ アサヒ 近藤 旭 (3) | 長崎西 | 16:58.48 | |
| 11 | 60 | アライ ハヤト 荒井 駿 (2) | 瓊浦 | 17:00.31 | |
| 12 | 845 | ミヤザキ カイリ 宮﨑 海里 (3) | 長崎南山 | 17:40.13 | |
| 13 | 837 | イリエ シオン 入江 詞音 (3) | 長崎南山 | 17:57.84 | |
| 14 | 834 | ヤマサキ ショウタロウ 山崎将太朗 (1) | 長崎南山 | 18:27.04 | |
| 15 | 1072 | ヤマウラ ショウゴ 山浦 翔吾 (2) | 海星 | 20:41.68 |