| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 桜が原 | 41:55 | |
| 2 | 福江 | 42:35 | |
| 3 | 小佐々 | 42:40 | |
| 4 | 芦辺 | 42:46 | |
| 5 | 西諫早 | 42:47 | |
| 6 | 明峰 | 42:51 | |
| 7 | 雞知 | 42:54 | |
| 8 | 長崎大附属 | 42:57 | |
| 9 | 深江 | 43:39 | |
| 10 | 勝本 | 43:41 | |
| 11 | 川棚 | 43:52 | |
| 12 | 玖島 | 43:59 | |
| 13 | 桜馬場 | 44:03 | |
| 14 | 志佐 | 44:08 | |
| 15 | 有家 | 44:09 | |
| 16 | 愛野 | 44:11 | |
| 17 | 長与 | 44:11 | |
| 18 | 山澄 | 44:21 | |
| 19 | 時津 | 44:33 | |
| 20 | 有明 | 44:42 | |
| 21 | 富江 | 44:46 | |
| 22 | 大船越 | 44:48 | |
| 23 | 波佐見 | 45:08 | |
| 24 | 国見 | 45:38 | |
| 25 | 魚目 | 45:44 | |
| 26 | 西海 | 45:48 | |
| 27 | 田平 | 46:00 | |
| 28 | 有川 | 46:02 | |
| 29 | 西彼 | 47:04 | |
| 30 | 南部 | 47:27 | |
| 31 | 島原第三 | 49:20 | |
| 32 | 御厨 | 49:48 |