| 順位 | 学校名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 西諫早 | 54:11 | |
| 2 | 西大村 | 55:04 | |
| 3 | 南有馬 | 55:17 | |
| 4 | 波佐見 | 55:25 | |
| 5 | 東長崎 | 55:33 | |
| 6 | 世知原 | 55:49 | |
| 7 | 川棚 | 55:59 | |
| 8 | 長与第二 | 56:00 | |
| 9 | 桜が原 | 56:15 | |
| 10 | 明峰 | 56:24 | |
| 11 | 喜々津 | 57:05 | |
| 12 | 小値賀 | 57:11 | |
| 13 | 長崎琴海 | 57:20 | |
| 14 | 小佐々 | 57:35 | |
| 15 | 大崎 | 57:44 | |
| 16 | 雞知 | 57:53 | |
| 17 | 長与 | 57:58 | |
| 18 | 長﨑大附属 | 58:00 | |
| 19 | 有明 | 58:28 | |
| 20 | 広田 | 58:36 | |
| 21 | 飯盛 | 58:43 | |
| 22 | 佐世保北 | 58:59 | |
| 23 | 愛野 | 59:19 | |
| 24 | 高来 | 59:46 | |
| 25 | 戸町 | 59:47 | |
| 26 | 西有家 | 59:59 | |
| 27 | 早岐 | 1:00:27 | |
| 28 | 諫早 | 1:00:32 | |
| 29 | 長田 | 1:00:39 | |
| 30 | 桜馬場 | 1:00:41 | |
| OP | 郡 | 55:37 | オープン |
| OP | 加津佐 | 59:13 | オープン |
| OP | 西海、西彼、大瀬戸 | 59:37 | オープン |
| OP | 深江 | 42:49 | オープン※4区まで |
| OP | 玖島 | 33:52 | オープン※3区まで |