| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2174 | オオヤマ ノゾム 大山 望夢 | 長崎大 | 15:39.59 | |
| 2 | 2240 | ヒダカ ヨウヘイ 日髙 陽平 | 県立大ｼｰﾎﾞﾙﾄ | 15:42.21 | |
| 3 | 2169 | アンラク リョウスケ 安楽 涼允 | 長崎大 | 15:45.08 | |
| 4 | 2470 | クリハラ コウヨウ 栗原 光陽 | 長崎市陸協 | 15:45.77 | |
| 5 | 2137 | ハマチ マサヒロ 浜地 雅浩 | 三菱重工RC | 15:48.35 | |
| 6 | 2182 | カワカミ マサヒロ 川上 真弘 | 長崎大 | 16:19.57 | |
| 7 | 2172 | サカタ ユウヤ 坂田 雄也 | 長崎大 | 16:31.07 | |
| 8 | 2453 | トクヤマ カズアキ 徳山 一彰 | 長崎大 | 16:36.88 | |
| 9 | 2161 | ヤマシタ トラノスケ 山下虎之佑 | 長崎大 | 16:37.82 | |
| 10 | 2452 | デグチ タツキ 出口 達基 | 長崎大 | 16:42.59 | |
| 11 | 2148 | オガワ ヨシヒロ 小川 祥広 | 長大医学部 | 16:44.63 | |
| 12 | 2033 | モトムラ ケンタ 本村 健太 | 長崎市陸協 | 16:46.44 | |
| 13 | 2275 | ヒラハタ ヨシキ 平畑 良季 | 長崎総科大 | 16:47.57 | |
| 14 | 2133 | タケツグ ケント 武次 賢人 | 三菱重工RC | 16:51.20 | |
| 15 | 2142 | ヤマモト ユウスケ 山本 裕介 | 三菱重工RC | 16:53.55 | |
| 16 | 2030 | アベ シンヤ 阿部 真也 | 長崎市陸協 | 16:55.85 | |
| 17 | 2167 | カトウ ユウジロウ 加藤裕次朗 | 長崎大 | 17:03.64 | |
| 18 | 491 | アカザワ ハルキ 赤澤 知樹 (1) | 長崎東 | 17:08.10 | |
| 19 | 586 | ナガノ トモヤ 長野 友弥 (2) | 長崎北 | 17:11.77 | |
| 20 | 589 | ヤマダ カズキ 山田 和樹 (2) | 長崎北 | 17:39.71 | |
| 21 | 1098 | ハシモト コウキ 橋本 洸稀 (1) | 長崎玉成 | 17:53.44 | |
| 22 | 1088 | カネコ セイヤ 金子 聖弥 (1) | 長崎玉成 | 17:53.74 | |
| 2127 | カミタニ ヨウイチ 紙谷 洋一 | 三菱重工RC | DNF |