| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 郡 | 52:50 | |
| 2 | 時津 | 52:52 | |
| 3 | 長与第二 | 53:31 | |
| 4 | 雞知 | 54:16 | |
| 5 | 世知原 | 54:45 | |
| 6 | 福江 | 54:47 | |
| 7 | 桜が原 | 54:56 | |
| 8 | 南有馬 | 55:01 | |
| 9 | 小佐々 | 56:00 | |
| 10 | 明峰 | 56:14 | |
| 11 | 佐々 | 56:51 | |
| 12 | 長田 | 56:54 | |
| 13 | 西海・大崎・大瀬戸・西彼 | 57:00 | |
| 14 | 長崎大附属 | 57:45 | |
| 15 | 広田 | 57:46 | |
| 16 | 大村 | 57:50 | |
| 17 | 喜々津 | 58:25 | |
| 18 | 長与 | 58:45 | |
| 19 | 西諫早 | 58:51 | |
| 20 | 田平 | 59:09 | |
| 21 | 有明 | 59:17 | |
| 22 | 波佐見 | 59:46 | |
| 23 | 清水 | 59:53 | |
| 24 | 小値賀 | 1:00:00 | |
| 25 | 東長崎 | 1:00:11 | |
| 26 | 戸町 | 1:00:47 | |
| 27 | 諫早高附属 | 1:01:06 | |
| 28 | 諫早 | 1:03:00 |