| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 三和 | 1:08:02 | |
| 2 | 三重 | 1:09:31 | |
| 3 | 三川 | 1:09:45 | |
| 4 | 橘 | 1:10:34 | |
| 5 | 戸町 | 1:10:36 | |
| 6 | 長崎大附属 | 1:11:18 | |
| 7 | 淵 | 1:11:46 | |
| 8 | 琴海 | 1:11:51 | |
| 9 | 山里 | 1:12:20 | |
| 10 | 横尾 | 1:12:20 | |
| 11 | 片淵 | 1:12:38 | |
| 12 | 小江原 | 1:12:47 | |
| 13 | 東長崎 | 1:12:47 | |
| 14 | 西浦上 | 1:12:49 | |
| 15 | 福田 | 1:13:17 | |
| 16 | 野母崎 | 1:13:29 | |
| 17 | 梅香崎 | 1:13:31 | |
| 18 | 土井首 | 1:13:31 | |
| 19 | 長崎東 | 1:13:46 | |
| 20 | 小島 | 1:13:51 | |
| 21 | 緑が丘 | 1:13:59 | |
| 22 | 小ヶ倉 | 1:13:59 | |
| 23 | 日見 | 1:14:09 | |
| 24 | 長崎 | 1:14:15 | |
| 25 | 丸尾 | 1:14:21 | |
| 26 | 桜馬場 | 1:14:31 | |
| 27 | 岩屋 | 1:14:51 | |
| 28 | 深堀 | 1:15:07 | |
| 29 | 西泊 | 1:15:15 | |
| 30 | 大浦 | 1:15:31 | |
| 31 | 滑石 | 1:16:11 | |
| 32 | 香焼 | 1:17:26 | |
| 33 | 茂木 | 1:21:32 | |
| 34 | 外海 | 1:22:42 |