| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 44:57 | |
| 2 | 土井首 | 45:19 | |
| 3 | 三重 | 45:41 | |
| 4 | 滑石 | 45:44 | |
| 5 | 東長崎 | 45:52 | |
| 6 | 橘 | 46:49 | |
| 7 | 桜馬場 | 46:52 | |
| 8 | 三川 | 46:53 | |
| 9 | 岩屋 | 47:16 | |
| 10 | 三和 | 47:23 | |
| 11 | 横尾 | 47:23 | |
| 12 | 梅香崎 | 47:31 | |
| 13 | 淵 | 47:48 | |
| 14 | 長崎東 | 47:50 | |
| 15 | 戸町 | 48:12 | |
| 16 | 山里 | 48:14 | |
| 17 | 長崎 | 48:23 | |
| 18 | 福田 | 48:29 | |
| 19 | 琴海 | 48:31 | |
| 20 | 小島 | 48:37 | |
| 21 | 緑が丘 | 48:50 | |
| 22 | 西泊 | 48:56 | |
| 23 | 小江原 | 49:09 | |
| 24 | 小ヶ倉 | 49:14 | |
| 25 | 日見 | 49:16 | |
| 26 | 茂木 | 50:06 | |
| 27 | 片淵 | 50:57 | |
| 28 | 深堀 | 51:45 | |
| 29 | 西浦上 | 52:41 | |
| 30 | 香焼 | 53:05 | |
| 31 | 大浦 | 53:19 | |
| 32 | 外海 | 54:04 | |
| 33 | 野母崎 | 54:41 |