| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 779 | ハマダ ユウガ 濱田 結雅 (1) | 長田中 | 4:56.53 | |
| 2 | 867 | ナカシマ ハヤト 中島 颯土 (1) | 高来中 | 4:58.27 | |
| 3 | 842 | トミオカ シュウセイ 冨岡 柊誠 (1) | 諫早中 | 5:00.00 | |
| 4 | 1064 | イシダ ヒロト 石田 大翔 (1) | 小野中 | 5:05.68 | |
| 5 | 896 | フカホリ リュウ 深堀 龍 (1) | 長田中 | 5:07.27 | |
| 6 | 850 | イワタ ヒロト 岩田 紘翔 (1) | 諫早中 | 5:10.96 | |
| 7 | 780 | マツオ コウセイ 松尾 晄成 (1) | 長田中 | 5:11.52 | |
| 8 | 866 | ミズカミ カナタ 水上 叶太 (1) | 高来中 | 5:12.14 | |
| 9 | 831 | マツモト イオリ 松本 伊織 (1) | 真城中 | 5:16.88 | |
| 10 | 1208 | ホンダ タケル 本多 健琉 (1) | 長崎日大中 | 5:17.15 | |
| 11 | 1049 | タグチ ユウガ 田口 優雅 (1) | 小長井中 | 5:17.61 | |
| 12 | 1277 | マツオ アキラ 松尾 旭 (1) | 北諫早中 | 5:18.84 | |
| 13 | 877 | ヨシモト テルマ 吉本 瑛真 (1) | 高来中 | 5:23.74 | |
| 14 | 1279 | モリ セイヨウ 森 聖陽 (1) | 北諫早中 | 5:25.87 | |
| 15 | 1060 | サカモト ヒロマサ 坂本 大将 (1) | 小野中 | 5:26.72 | |
| 16 | 1276 | ヒガシネ カイリ 東根 海璃 (1) | 北諫早中 | 5:27.22 | |
| 17 | 868 | チカマツ ケント 近松 賢人 (1) | 高来中 | 5:32.50 | |
| 18 | 1282 | タサキ シュウタ 田﨑 修太 (1) | 北諫早中 | 5:32.94 | |
| 19 | 812 | ハシモト ハヤト 橋本 隼 (1) | 諫早琴海中 | 5:56.24 | |
| 20 | 895 | ノザキ リオン 野崎 凌牡 (1) | 長田中 | 6:24.02 | |
| 1043 | スエナガ マコト 末長 眞 (1) | 小長井中 | DNS | ||
| 1044 | ツツミ ハルト 堤 悠人 (1) | 小長井中 | DNS | ||
| 828 | ナカオ リュウ 中尾 隆 (1) | 真城中 | DNS |