| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 121 | タワラ ショウキ 俵 匠生 (1) | 雞知 | 4:19.03 | NGR |
| 2 | 1614 | キド カイシュウ 木戸 海秀 (1) | 長与第二 | 4:29.83 | |
| 3 | 416 | ナカムラ ユウノスケ 中村勇之輔 (1) | 福江 | 4:33.93 | |
| 4 | 408 | オオサコ レイト 大窄 麗斗 (1) | 福江 | 4:33.97 | |
| 5 | 1642 | ヤマシタ シュウヤ 山下 柊哉 (1) | 時津 | 4:41.52 | |
| 6 | 134 | ショウジ シュンタ 庄司 旬汰 (1) | 久田 | 4:41.62 | |
| 7 | 1716 | モリタ ウミ 森田 海 (1) | 福田 | 4:42.83 | |
| 8 | 332 | トガワ リュウガ 戸川 琉雅 (1) | 魚目 | 4:43.01 | |
| 9 | 1125 | モモタ コウキ 百田 好希 (1) | 西諫早 | 4:44.25 | |
| 10 | 1402 | マツバラ シンジ 松原 慎治 (1) | 島原第一 | 4:44.91 | |
| 11 | 1753 | カモガワ カズキ 鴨川 和生 (1) | 長崎大附属 | 4:45.70 | |
| 12 | 203 | ヒダカ ミナト 日髙 湊人 (1) | 郷ノ浦 | 4:48.63 | |
| 13 | 818 | ヤマグチ カナト 山口 叶人 (1) | 早岐 | 4:49.66 | |
| 14 | 914 | タカダ ユウゴウ 髙田 優剛 (1) | 波佐見 | 4:54.08 | |
| 15 | 629 | クボカワ ジン 久保川 仁 (1) | 調川 | 4:54.30 | |
| 16 | 204 | カセダ リクウ 加㔟田莉空 (1) | 郷ノ浦 | 4:56.34 | |
| 17 | 1036 | モリヤマ ジント 森山 仁斗 (1) | 大村 | 4:56.53 | |
| 18 | 624 | ヨシウラ ヒロト 吉浦 広翔 (1) | 志佐 | 4:57.59 | |
| 19 | 1452 | ホンダ トエル 本多 董偉 (1) | 有明 | 4:59.78 | |
| 20 | 1122 | ハシモト トラノスケ 橋本虎之介 (1) | 西諫早 | 5:00.95 | |
| 21 | 303 | カワバタ ヒロト 川端 大翔 (1) | 上五島 | 5:04.61 | |
| 22 | 836 | エガシラ リョウマ 江頭 遼馬 (1) | 相浦 | 5:04.75 | |
| 23 | 1320 | コブチ コウル 小渕 響流 (1) | 南有馬 | 5:06.22 | |
| 24 | 505 | トムラ ダイキ 戸村 大紀 (1) | 平戸 | 5:09.47 | |
| 25 | 1209 | オオクボ タクマ 大久保匠真 (1) | 国見 | 5:14.34 | |
| 26 | 1334 | ハヤシダ エイタ 林田 瑛太 (1) | 西有家 | 5:14.73 | |
| 27 | 916 | ミヤタ タクマ 宮田 拓真 (1) | 波佐見 | 5:18.06 | |
| 28 | 1046 | サトウ ヒロト 佐藤 優斗 (1) | 桜が原 | 5:22.01 | |
| 29 | 526 | シンタテ アンジ 新立 安慈 (1) | 田平 | 5:25.33 | |
| 30 | 1221 | ミウラ マサヒロ 三浦 雅大 (1) | 愛野 | 5:25.68 | |
| 31 | 1529 | ハヤタ ユウシ 早田 結虹 (1) | 大崎 | 5:28.77 | |
| 32 | 1523 | ヤマサキ ヒビキ 山﨑 響 (1) | 西海 | 5:28.86 |