| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1142 | ムタ ソウタ 牟田 颯太 (3) | 森山 | 4:11.83 | |
| 2 | 1143 | ムタ リンタ 牟田 凜太 (3) | 森山 | 4:11.91 | |
| 3 | 824 | マツシタ ケンシン 松下 健心 (3) | 山澄 | 4:11.98 | |
| 4 | 1019 | ナカ ハルト 中 遥翔 (3) | 郡 | 4:13.24 | |
| 5 | 1624 | シバヤマ カナメ 柴山 叶夢 (3) | 時津 | 4:15.84 | |
| 6 | 1702 | クロキ リョウマ 黒木 凌真 (3) | 東長崎 | 4:19.79 | |
| 7 | 127 | ワカマツ ソウ 若松 颯 (3) | 厳原 | 4:20.71 | |
| 8 | 1217 | キタジマ トモヤ 北嶋 友哉 (3) | 愛野 | 4:22.08 | |
| 9 | 801 | マツモト カイト 松本 快斗 (3) | 広田 | 4:22.52 | |
| 10 | 115 | ツイキ ユウナン 築城 優男 (3) | 豊玉 | 4:23.80 | |
| 11 | 407 | ナツイ コウダイ 夏井 航大 (3) | 福江 | 4:25.64 | |
| 12 | 910 | イトウ タイガ 伊藤 大牙 (3) | 波佐見 | 4:27.63 | |
| 13 | 1013 | ヤマモト ショウブ 山本 菖蒲 (3) | 西大村 | 4:30.32 | |
| 14 | 234 | ナカムラ ケンヤ 中村 拳也 (3) | 石田 | 4:31.32 | |
| 15 | 1514 | ナガオカ コウタ 長岡 洸太 (3) | 西海 | 4:31.61 | |
| 16 | 626 | クボカワ ハジメ 久保川 一 (3) | 調川 | 4:33.82 | |
| 17 | 232 | トヨタ ジョウジロウ 豊田丈次郎 (3) | 石田 | 4:34.03 | |
| 18 | 622 | ヒラタ リツ 平田 吏翼 (3) | 志佐 | 4:34.56 | |
| 19 | 1519 | トジマ ハヤト 冨嶋 颯音 (3) | 西海 | 4:36.68 | |
| 20 | 903 | カワハラ リョウメイ 川原 崚盟 (3) | 東彼杵 | 4:38.53 | |
| 21 | 1741 | ナカムラ ショウゴ 中村 匠吾 (3) | 長崎琴海 | 4:40.11 | |
| 22 | 322 | タムラ タクト 田村 匠登 (3) | 魚目 | 4:42.97 | |
| 23 | 428 | クワムラ カズミ 桑村 和海 (3) | 岐宿 | 4:43.27 | |
| 24 | 1324 | ヨシダ カイシ 吉田 快志 (3) | 西有家 | 4:43.91 | |
| 25 | 1414 | オオバ ナオヒロ 大場 斉訓 (3) | 島原第三 | 4:47.70 | |
| 26 | 502 | イシダ ハルキ 石田 悠樹 (3) | 平戸 | 4:50.18 | |
| 27 | 339 | ナカムラ シュウヘイ 中村 柊平 (3) | 魚目 | 4:52.15 | |
| 28 | 524 | タシマ レオ 田島 獅王 (3) | 田平 | 4:54.03 | |
| 29 | 1323 | ハクカワ セイヨウ 伯川 聖陽 (3) | 西有家 | 4:57.34 | |
| 30 | 1433 | オオツ ソウマ 大津 颯馬 (3) | 三会 | 5:02.36 |