| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 313 | ウチダ リョウタ 内田 涼太 (2) | 西諫早 | 4:26.54 | |
| 2 | 317 | ナカガワ ヒトシ 中川 仁 (2) | 西諫早 | 4:37.50 | |
| 3 | 1112 | ヨコオ ハルキ 横尾 悠稀 (2) | 森山 | 4:40.37 | |
| 4 | 417 | ナカヤ ユウト 中屋 悠人 (2) | 明峰 | 4:45.74 | |
| 5 | 1310 | ナカウチ ヒナタ 中内 陽向 (2) | 小長井 | 4:48.90 | |
| 6 | 315 | スエタ コタロウ 末田琥太郎 (2) | 西諫早 | 4:49.37 | |
| 7 | 442 | タゾエ ケイスケ 田添 慶介 (2) | 明峰 | 4:51.97 | |
| 8 | 835 | キハラ サトシ 木原 惺 (2) | 真城 | 4:53.58 | |
| 9 | 841 | ジンノ マサト 陣野 将人 (2) | 真城 | 4:55.21 | |
| 10 | 1808 | スズキ カイセイ 鈴木 快青 (2) | 諫早高附属 | 4:55.82 | |
| 11 | 1004 | シバハラ キスイ 柴原 祈彗 (2) | 長崎日大 | 4:58.02 | |
| 12 | 1104 | コジマ タイセイ 小島 大征 (2) | 森山 | 5:00.44 | |
| 13 | 1106 | セトグチ ナオキ 瀬戸口直己 (2) | 森山 | 5:06.89 | |
| 14 | 436 | マツオ ユウホ 松尾 侑歩 (2) | 明峰 | 5:06.90 | |
| 15 | 714 | クサノ リク 草野 梨駆 (2) | 北諫早 | 5:08.16 | |
| 16 | 1108 | ナカドオリ カズマ 中通 一馬 (2) | 森山 | 5:23.22 |