| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 44:51 | |
| 2 | 三川 | 46:02 | |
| 3 | 東長崎 | 46:03 | |
| 4 | 三重 | 46:26 | |
| 5 | 山里 | 46:41 | |
| 6 | 滑石 | 46:56 | |
| 7 | 桜馬場 | 47:30 | |
| 8 | 緑が丘 | 47:41 | |
| 9 | 三和 | 47:42 | |
| 10 | 福田 | 47:47 | |
| 11 | 岩屋 | 48:32 | |
| 12 | 土井首 | 48:44 | |
| 13 | 琴海 | 48:58 | |
| 14 | 小江原 | 49:09 | |
| 15 | 小ヶ倉 | 49:28 | |
| 16 | 小島 | 49:45 | |
| 17 | 戸町 | 49:51 | |
| 18 | 横尾 | 50:08 | |
| 19 | 淵 | 50:15 | |
| 20 | 日見 | 50:24 | |
| 21 | 西浦上 | 50:31 | |
| 22 | 梅香崎 | 50:41 | |
| 23 | 西泊 | 50:41 | |
| 24 | 長崎 | 51:03 | |
| 25 | 片淵 | 51:26 | |
| 26 | 長崎東 | 51:47 | |
| 27 | 大浦 | 53:02 | |
| 28 | 橘 | 53:20 | |
| 29 | 深堀 | 56:01 | |
| 30 | 香焼 | 58:21 |