| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 361 | アイカワ マサキ 相川 正樹 (2) | 大村工 | 16:00.91 | |
| 2 | 837 | コマイ レン 駒井 蓮 (1) | 諫早農 | 16:44.26 | |
| 3 | 52 | ヒラタ リツ 平田 吏翼 (1) | 創成館 | 16:48.49 | |
| 4 | 740 | ヒラヤマ サクタロウ 平山朔大朗 (2) | 長崎日本大学 | 17:01.22 | |
| 5 | 739 | マツモト ソウタ 松本 爽汰 (2) | 長崎日本大学 | 17:08.64 | |
| 6 | 54 | イトウ カナタ 伊藤 奏太 (1) | 創成館 | 17:20.39 | |
| 7 | 385 | ナカタ タケト 中田 武斗 (2) | 島原特別支援 | 17:24.14 | |
| 8 | 51 | ナガオカ コウタ 長岡 洸太 (1) | 創成館 | 17:30.08 | |
| 9 | 552 | イワナガ キョウスケ 岩永 恭典 (2) | 西陵 | 17:30.14 | |
| 10 | 755 | タケスエ ケンゴ 武末 健悟 (1) | 長崎日本大学 | 17:43.92 | |
| 11 | 356 | イチノミヤ ライタ 一宮 礼汰 (2) | 大村工 | 17:46.89 | |
| 12 | 45 | カワノ アキトシ 河野 彰駿 (2) | 創成館 | 17:54.84 | |
| 13 | 804 | トミタ リュウノスケ 冨田龍之介 (2) | 諫早農 | 17:58.25 | |
| 14 | 548 | マツイ カズマ 松井 千真 (2) | 西陵 | 18:02.37 | |
| 15 | 328 | マツオ ユウマ 松尾 悠真 (2) | 口加 | 18:02.64 | |
| 16 | 759 | ソエジマ コタロウ 副嶋琥太郎 (1) | 長崎日本大学 | 18:12.61 | |
| 17 | 816 | ワタナベ ユウセイ 渡部 雄誠 (2) | 諫早農 | 18:16.13 | |
| 18 | 364 | カワグチ シュウガ 川口 修駕 (1) | 大村工 | 18:30.71 | |
| 19 | 553 | タゾエ ソウタ 田添 颯太 (2) | 西陵 | 18:50.11 | |
| 20 | 805 | イシダ アユム 石田 歩夢 (2) | 諫早農 | 19:00.05 | |
| 21 | 726 | ババ ケイセイ 馬場 啓成 (2) | 長崎日本大学 | 19:08.30 | |
| 22 | 456 | ハヤシダ カズオリ 林田 百織 (2) | 島原 | 19:10.62 | |
| 23 | 811 | イノウエ ユウタ 井上 裕太 (2) | 諫早農 | 19:18.14 | |
| 24 | 368 | ヨシナガ コウヘイ 吉永 滉平 (1) | 大村工 | 19:45.79 | |
| 343 | サエキ コウタロウ 佐伯洸太朗 (3) | 大村工 | 17:10.54 | OPN | |
| 344 | サカイ マホロ 酒井 真幌 (3) | 大村工 | 17:44.10 | OPN | |
| 350 | タカオ ケンシ 髙尾 拳士 (3) | 大村工 | 18:38.27 | OPN | |
| 349 | クマ セイシン 久間 晴心 (3) | 大村工 | 16:01.77 | OPN | |
| 360 | ヤマシタ ユウマ 山下 優馬 (2) | 大村工 | DNF |