| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 130 | サカイ リョウ 酒井 良 (1) | 雞知 | 4:33.72 | |
| 2 | 1009 | エグチ ユウ 江口 優 (1) | 玖島 | 4:35.78 | |
| 3 | 612 | ハセガワ ガオウ 長谷川雅皇 (1) | 志佐 | 4:35.81 | |
| 4 | 1121 | ヨネミツ フウマ 米満 楓馬 (1) | 西諫早 | 4:39.28 | |
| 5 | 133 | ヤスダ アユム 安田 歩生 (1) | 豊玉 | 4:39.36 | |
| 6 | 1017 | モリヤマ アイト 森山 心翔 (1) | 西大村 | 4:39.49 | |
| 7 | 1670 | ナルセ ナツキ 鳴瀬 夏輝 (1) | 青雲 | 4:44.54 | |
| 8 | 216 | ニシノ アオイ 西野 蒼生 (1) | 勝本 | 4:47.22 | |
| 9 | 211 | サイトウ マコト 齋藤 諒 (1) | 郷ノ浦 | 4:47.29 | |
| 10 | 1306 | モリ ユウタロウ 森 雄太郎 (1) | 口之津 | 4:50.51 | |
| 11 | 1743 | ナガオ レオ 長尾 羚煌 (1) | 長崎琴海 | 4:50.78 | |
| 12 | 1661 | ハラダ エイタ 原田 瑛太 (1) | 青雲 | 4:51.93 | |
| 13 | 315 | キリエ カナタ 切江 叶太 (1) | 魚目 | 4:52.19 | |
| 14 | 817 | ホンダ ケンシン 本田 賢伸 (1) | 早岐 | 4:52.27 | |
| 15 | 1739 | ナカタ ミライ 中田 未來 (1) | 小ヶ倉 | 4:54.37 | |
| 16 | 431 | オオハラ カケル 大原 翔 (1) | 富江 | 4:54.42 | |
| 17 | 332 | ナカムラ ユウリ 中村 悠力 (1) | 有川 | 4:54.53 | |
| 18 | 1409 | シモダ レオ 下田 陸王 (1) | 島原第一 | 4:57.81 | |
| 19 | 1233 | モリシタ ダイア 森下 大空 (1) | 南串 | 4:58.66 | |
| 20 | 1323 | ハヤシダ ヒイロ 林田 陽路 (1) | 西有家 | 4:59.57 | |
| 21 | 815 | イトウ シズル 伊藤 静流 (1) | 早岐 | 5:00.29 | |
| 22 | 913 | マツザキ カイリ 松﨑 海璃 (1) | 川棚 | 5:00.95 | |
| 23 | 417 | アラキ ケイタ 荒木 恵大 (1) | 福江 | 5:04.32 | |
| 24 | 514 | ツルマル ユウタ 鶴丸 祐太 (1) | 田平 | 5:08.43 | |
| 25 | 1211 | ヤマモト タイセイ 山本 泰聖 (1) | 国見 | 5:08.87 | |
| 26 | 906 | ナカシマ タカラ 中島 宝良 (1) | 東彼杵 | 5:09.11 | |
| 27 | 1144 | ナカドオリ マサト 中通 雅斗 (1) | 森山 | 5:10.50 | |
| 28 | 616 | タナカ シュンセイ 田中 駿成 (1) | 志佐 | 5:10.83 | |
| 29 | 1505 | オオクボ ハルキ 大久保春生 (1) | 西彼 | 5:17.30 | |
| 30 | 1551 | アライ リョウタ 新井 亮太 (1) | 大瀬戸 | 5:19.45 | |
| 31 | 509 | モリ タイガ 森 太雅 (1) | 度島 | 5:22.62 | |
| 1417 | オオマチ ソウハ 大町 爽翔 (1) | 島原第三 | DNS |