| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 西諫早 | 42:06 | |
| 2 | 雞知 | 42:50 | |
| 3 | 長崎大附属 | 43:20 | |
| 4 | 志佐 | 43:27 | |
| 5 | 鳴北 | 43:32 | |
| 6 | 郡 | 43:44 | |
| 7 | 広田 | 43:45 | |
| 8 | 明峰 | 43:59 | |
| 9 | 愛野 | 44:32 | |
| 10 | 中里 | 44:38 | |
| 11 | 郷ノ浦 | 45:05 | |
| 12 | 山里 | 45:13 | |
| 13 | 玖島 | 45:15 | |
| 14 | 有川 | 45:27 | |
| 15 | 時津 | 45:33 | |
| 16 | 芦辺 | 45:47 | |
| 17 | 有明 | 46:02 | |
| 18 | 上五島 | 46:23 | |
| 19 | 平戸 | 46:30 | |
| 20 | 南部 | 46:31 | |
| 21 | 西海 | 46:33 | |
| 22 | 西有家 | 46:34 | |
| 23 | 深江 | 46:36 | |
| 24 | 岐宿 | 46:38 | |
| 25 | 国見 | 46:39 | |
| 26 | 厳原 | 46:47 | |
| 27 | 川棚 | 46:57 | |
| 28 | 島原第三 | 47:26 | |
| 29 | 福江 | 47:40 | |
| 30 | 大瀬戸 | 48:42 | |
| 31 | 東彼杵 | 49:09 | |
| 32 | 調川 | 49:43 |