| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 176 | ヨコタ カイト (08) 横田 海斗 (3) | 小長井中 | 2:37.35 | |
| 2 | 493 | ウエムラ コハク (08) 植村 虎白 (3) | 世知原中 | 2:38.92 | |
| 3 | 353 | ハシモト トラノスケ (08) 橋本虎之介 (2) | 西諫早中 | 2:40.38 | |
| 4 | 216 | キド カイシュウ (08) 木戸 海秀 (2) | 長与第二中 | 2:40.63 | |
| 5 | 1283 | コジマ ライト (07) 小島 徠斗 (3) | 大船越中 | 2:42.16 | |
| 6 | 743 | ニシヤマ ノア (07) 西山 乃天 (1) | 長崎日本大学高 | 2:43.37 | |
| 7 | 743 | シバヤマ カケル (07) 柴山 翔光 (3) | 時津中 | 2:44.44 | |
| 8 | 2139 | サクナガ ソラ (07) 作永 蒼空 (3) | MRC SASEBO | 2:46.11 | |
| 9 | 451 | オダ リョウゾウ (07) 小田 凌三 (3) | 国見中 | 2:46.32 | |
| 10 | 755 | ハマグチ ラク (09) 濵口 楽 (2) | 時津中 | 2:48.10 | |
| 11 | 564 | イケダ ヒュウマ (07) 池田 彪馬 (3) | 小野中 | 2:48.47 | |
| 12 | 1060 | コバヤシ シュンノスケ(07) 小林駿之介 (1) | 長崎南高 | 2:50.44 | |
| 13 | 771 | タケガワ リク (07) 竹川 璃空 (3) | 有川中 | 2:52.45 | |
| 14 | 214 | セトグチ リョウ (07) 瀬戸口 諒 (3) | 長与第二中 | 2:53.79 | |
| 15 | 1148 | ゴトウ ヒイロ (07) 後藤 洋楼 (3) | 大野中 | 2:53.82 | |
| 16 | 742 | マエダ コウシュン (07) 前田 光舜 (3) | 時津中 | 3:01.54 |