| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 44:35 | |
| 2 | 山里 | 45:52 | |
| 3 | 岩屋 | 45:58 | |
| 4 | 桜馬場 | 46:40 | |
| 5 | 三重 | 46:47 | |
| 6 | 小島 | 47:02 | |
| 7 | 三和 | 47:08 | |
| 8 | 琴海 | 47:20 | |
| 9 | 緑が丘 | 47:28 | |
| 10 | 東長崎 | 47:50 | |
| 11 | 滑石 | 47:51 | |
| 12 | 橘 | 48:52 | |
| 13 | 西泊 | 48:52 | |
| 14 | 長崎東 | 49:02 | |
| 15 | 小江原 | 49:04 | |
| 16 | 西浦上 | 49:20 | |
| 17 | 淵 | 49:46 | |
| 18 | 福田 | 49:49 | |
| 19 | 梅香崎 | 49:59 | |
| 20 | 横尾 | 50:11 | |
| 21 | 三川 | 50:24 | |
| 22 | 長崎 | 50:58 | |
| 23 | 小ヶ倉 | 51:03 | |
| 24 | 大浦 | 51:13 | |
| 25 | 日見 | 51:30 | |
| 26 | 戸町 | 52:06 | |
| 27 | 深堀 | 53:34 | |
| 28 | 片淵 | 54:09 | |
| 29 | 茂木 | 54:33 |