| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2604 | アビル カズヒロ 阿比留和弘 | 対馬 | 4:05.52 | |
| 2 | 1405 | ヤマグチ タカト 山口 誉斗 | 諫早 | 4:06.84 | |
| 3 | 2752 | マエダ シンタロウ 前田真太郎 | 雲仙 | 4:07.62 | |
| 4 | 1702 | マツセ ユウキ 松瀬 光希 | 松浦 | 4:11.08 | |
| 5 | 1205 | ニシカワ カツヒコ 西川 勝彦 | 佐世保 | 4:11.64 | |
| 6 | 2757 | オオクボ マモル 大久保 守 | 雲仙 | 4:15.08 | |
| 7 | 1504 | フクダ アユム 福田 渉 | 大村 | 4:15.96 | |
| 8 | 1301 | マツオ リク 松尾 玲玖 | 島原 | 4:16.27 | |
| 9 | 2602 | ヤスダ ハルマ 安田 栄真 | 対馬 | 4:17.35 | |
| 10 | 1108 | ヤマシタ トラノスケ 山下虎之佑 | 長崎 | 4:18.68 | |
| 11 | 1204 | モリグチ リョウタロウ 森口凌太朗 | 佐世保 | 4:21.86 | |
| 12 | 1111 | イシダ ヒロキ 石田 紘樹 | 長崎 | 4:29.99 | |
| 13 | 1306 | トクナガ コウキ 徳永 晃希 | 島原 | 4:32.96 | |
| 14 | 1503 | オオサキ タツキ 大﨑 健貴 | 大村 | 4:36.98 | |
| 15 | 1612 | マツオ ショウヘイ 松尾 勝平 | 平戸 | 4:38.63 | |
| 16 | 1406 | ハヤシダ ソウタ 林田 颯太 | 諫早 | 4:52.20 | |
| 17 | 1701 | シライシ カイト 白石 海斗 | 松浦 | 4:53.24 | |
| 18 | 2420 | トヨマス マサヒロ 豊増 雅大 | 壱岐 | 5:31.68 | |
| 2119 | タカハラ ナオキ 高原 尚輝 | 南島原 | DNS | ||
| 2105 | アキヤマ ハルキ 穐山 春樹 | 南島原 | DNS |