| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 98 | コガネマル カンタ 小金丸幹太 (3) | 長崎大附属 | 9:26.97 | |
| 2 | 90 | キヤ カイト 木谷 海仁 (3) | 長崎大附属 | 9:31.53 | |
| 3 | 319 | キタ ヨウスケ 喜多 洋介 (3) | 青雲 | 9:38.25 | |
| 4 | 89 | カモガワ カズキ 鴨川 和生 (3) | 長崎大附属 | 9:43.08 | |
| 5 | 312 | ナルセ ナツキ 鳴瀬 夏輝 (2) | 青雲 | 9:54.53 | |
| 6 | 182 | モリ ソウスケ 森 奏輔 (2) | 三重 | 9:59.82 | |
| 7 | 965 | コヤナギ アオシ 小栁 葵獅 (1) | 長崎大附属 | 10:04.50 | |
| 8 | 65 | ムラセ タクミ 村瀬 巧 (2) | 緑が丘 | 10:31.47 | |
| 9 | 93 | デグチ ジョウ 出口 丈 (2) | 長崎大附属 | 10:35.74 | |
| 10 | 177 | タカハシ タケル 髙橋 丈瑠 (2) | 長崎 | 10:35.89 | |
| 11 | 97 | オバタ ソウシロウ 小畑聡史朗 (2) | 長崎大附属 | 10:41.37 | |
| 12 | 968 | サカモト スイショウ 坂本 水晶 (1) | 長崎大附属 | 10:47.22 | |
| 13 | 1163 | ヤマグチ ヒョウセイ 山口 彪星 (1) | 東長崎 | 11:00.99 | |
| 14 | 723 | ワシオ ケンスケ 鷲尾 健介 (1) | 長崎 | 11:17.73 | |
| 15 | 964 | イトウ ソウシ 伊藤 颯志 (1) | 長崎大附属 | 11:32.06 | |
| 16 | 909 | フクダ サネユキ 福田 真之 (1) | 長崎 | 12:05.95 | |
| 17 | 956 | ミナワ チヒロ 三縄 千洋 (1) | 長崎大附属 | 12:45.73 |