| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 337 | ヨコタ カイト 横田 海斗 (1) | 諫早農 | 4:12.80 | |
| 2 | 323 | コマイ レン 駒井 蓮 (2) | 諫早農 | 4:16.42 | |
| 3 | 139 | アイカワ ハヤト 會川 隼人 (2) | 大村 | 4:19.01 | |
| 4 | 910 | キド マサト 城戸 将翔 (2) | 諫早商 | 4:23.25 | |
| 5 | 716 | フジシマ ユウタ 藤島 悠太 (1) | 長崎日本大学 | 4:23.93 | |
| 6 | 326 | ノグチ カイタ 野口 海太 (2) | 諫早農 | 4:23.98 | |
| 7 | 700 | シバハラ キスイ 柴原 祈慧 (1) | 長崎日本大学 | 4:24.25 | |
| 8 | 691 | ソエジマ コタロウ 副嶋琥太郎 (2) | 長崎日本大学 | 4:24.79 | |
| 9 | 145 | ヤマグチ ヒナタ 山口 陽太 (1) | 大村 | 4:25.56 | |
| 10 | 138 | マツモト タスク 松本 大育 (2) | 大村 | 4:25.60 | |
| 11 | 332 | キハラ サトシ 木原 惺 (1) | 諫早農 | 4:29.29 | |
| 12 | 311 | オオガ ショウ 大我 奨 (2) | 諫早農 | 4:29.45 | |
| 13 | 719 | コサザ ケイスケ 小佐々恵佑 (1) | 長崎日本大学 | 4:33.37 | |
| 14 | 141 | オサキ ユウト 尾﨑 悠人 (1) | 大村 | 4:38.91 | |
| 15 | 913 | キシカワ トシヤ 岸川 寿也 (2) | 諫早商 | 4:41.22 | |
| 16 | 285 | オニヤマ ショウマ 鬼山 翔真 (1) | 島原工 | 5:02.12 |