| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1012 | エグチ ユウ 江口 優 (2) | 玖島 | 4:14.54 | |
| 2 | 124 | サカイ リョウ 酒井 良 (2) | 雞知 | 4:15.45 | |
| 3 | 606 | ハセガワ ガオウ 長谷川雅皇 (2) | 志佐 | 4:17.02 | |
| 4 | 131 | ヤマグチ ヒロキ 山口 裕輝 (2) | 雞知 | 4:19.21 | |
| 5 | 1015 | モリヤマ アイト 森山 心翔 (2) | 西大村 | 4:19.43 | |
| 6 | 1741 | ナガオ レオ 長尾 羚煌 (2) | 長崎琴海 | 4:26.33 | |
| 7 | 1303 | モリ ユウタロウ 森 雄太郎 (2) | 口之津 | 4:26.36 | |
| 8 | 1648 | ナルセ ナツキ 鳴瀬 夏輝 (2) | 青雲 | 4:27.07 | |
| 9 | 410 | コイデ アツシ 小出 篤志 (2) | 福江 | 4:29.59 | |
| 10 | 1133 | ヨネミツ フウマ 米満 楓馬 (2) | 西諫早 | 4:31.63 | |
| 11 | 808 | ホンダ ケンシン 本田 賢伸 (2) | 早岐 | 4:33.34 | |
| 12 | 230 | イマニシ ユウタロウ 今西勇大郎 (2) | 石田 | 4:34.92 | |
| 13 | 906 | ナカシマ タカラ 中島 宝良 (2) | 東彼杵 | 4:35.47 | |
| 14 | 1322 | ハヤシダ ヒイロ 林田 陽路 (2) | 西有家 | 4:37.74 | |
| 15 | 619 | ヨシオカ リクト 吉岡 陸翔 (2) | 調川 | 4:41.49 | |
| 16 | 1148 | ヨシダ カズキ 吉田 一貴 (2) | 喜々津 | 4:42.20 | |
| 17 | 211 | サイトウ マコト 齋藤 諒 (2) | 郷ノ浦 | 4:44.35 | |
| 18 | 522 | モリシタ エル 森下 永琉 (2) | 田平 | 4:44.37 | |
| 19 | 318 | キリエ カナタ 切江 叶太 (2) | 魚目 | 4:45.60 | |
| 20 | 1640 | オオツボ カナト 大坪 奏仁 (2) | 時津 | 4:47.47 | |
| 21 | 1236 | モリシタ ダイア 森下 大空 (2) | 南串 | 4:48.05 | |
| 22 | 909 | マツザキ カイリ 松﨑 海璃 (2) | 川棚 | 4:48.19 | |
| 23 | 1726 | エガワ ソウタ 江川 奏太 (2) | 滑石 | 4:53.40 | |
| 24 | 427 | マツモト ミナト 松本 湊 (2) | 翁頭 | 4:53.94 | |
| 25 | 337 | ナカムラ ユウリ 中村 悠力 (2) | 有川 | 4:56.27 | |
| 26 | 1421 | オオマチ ソウハ 大町 爽翔 (2) | 島原第三 | 4:57.66 | |
| 27 | 1527 | タニガワ リク 谷川 颯 (2) | 大崎 | 4:58.75 | |
| 28 | 1204 | ヤマモト タイセイ 山本 泰聖 (2) | 国見 | 4:58.99 | |
| 29 | 1504 | トミナガ マサハル 冨永 雅温 (2) | 西彼 | 4:59.33 | |
| 30 | 842 | ツジタ リョウジュ 辻󠄀田 凌壽 (2) | 中里 | 5:00.58 | |
| 31 | 530 | ツルマル ユウタ 鶴丸 祐太 (2) | 田平 | 5:02.13 | |
| 1402 | シモダ レオ 下田 陸王 (2) | 島原第一 | DNS |