| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 雞知 | 52:15 | |
| 2 | 西諫早 | 52:25 | |
| 3 | 波佐見 | 53:24 | |
| 4 | 時津 | 53:51 | |
| 5 | 長崎大附属 | 54:12 | |
| 6 | 福江 | 55:01 | |
| 7 | 中里 | 55:27 | |
| 8 | 森山 | 55:41 | |
| 9 | 志佐 | 55:51 | |
| 10 | 西大村 | 56:01 | |
| 11 | 広田 | 56:06 | |
| 12 | 清水 | 56:26 | |
| 13 | 長与 | 56:28 | |
| 14 | 西泊 | 56:45 | |
| 15 | 長与第二 | 56:48 | |
| 16 | 田平 | 56:59 | |
| 17 | 玖島 | 57:11 | |
| 18 | 西有家 | 57:22 | |
| 19 | 東彼杵 | 57:30 | |
| 20 | 諫早高附属 | 57:38 | |
| 21 | 佐々 | 58:01 | |
| 22 | 福田 | 58:07 | |
| 23 | 大村 | 58:16 | |
| 24 | 国見 | 59:59 | |
| 25 | 諌早 | 1:00:28 | |
| 26 | 青雲 | 1:00:36 | |
| 27 | 北諫早 | 1:00:58 | |
| 28 | 桜が原 | 1:01:08 | |
| 29 | 郡 | 1:01:42 | |
| 30 | 岩屋 | 1:02:02 | |
| 31 | 三重 | 1:02:27 |