| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 834 | トミヤマ ソウシ 冨山 颯士 (1) | 高来 | 4:37.97 | |
| 2 | 712 | キタミカ タイキ 北御門大輝 (1) | 長田 | 4:38.56 | |
| 3 | 512 | クマモト コジロウ 隈本虎次郎 (1) | 小長井 | 4:38.61 | |
| 4 | 983 | ナカセ コウ 中瀬 昊 (1) | 諫早 | 5:06.37 | |
| 5 | 833 | マメダ タツロウ 豆田 達郎 (1) | 高来 | 5:08.11 | |
| 6 | 1066 | ニシオカ リン 西岡 凜 (1) | 西諫早 | 5:08.13 | |
| 7 | 984 | ヤマシタ ヒカル 山下 輝 (1) | 諫早 | 5:12.15 | |
| 8 | 979 | シモダ ケイタ 下田 慶太 (1) | 諫早 | 5:24.08 | |
| 9 | 777 | ヤマウチ ソウタ 山内 蒼太 (1) | 琴海 | 5:26.21 | |
| 10 | 750 | マエダ ダント 前田 暖人 (1) | 小野 | 5:26.60 | |
| 11 | 853 | ヤマグチ マサハル 山口 雅陽 (1) | 明峰 | 5:27.01 | |
| 12 | 514 | ワタベ タイガ 渡部 大雅 (1) | 小長井 | 5:31.46 | |
| 13 | 980 | ミゾタ ケンゴ 溝田 健吾 (1) | 諫早 | 5:36.57 | |
| 14 | 3008 | ツジノ ライガ 辻󠄀野 礼雅 (1) | 西諫早 | 5:39.86 | |
| 15 | 713 | シモダ リク 下田 流空 (1) | 長田 | 5:42.28 | |
| 16 | 776 | ツジ セイナ 辻󠄀 惺凪 (1) | 琴海 | 5:43.94 | |
| 17 | 738 | ヤノ タツヤ 矢野 達也 (1) | 諫早高附属 | 6:00.79 | |
| 18 | 775 | オオクボ ソウスケ 大久保颯介 (1) | 琴海 | 6:05.60 | |
| 19 | 737 | ナカノ アラタ 中野 新汰 (1) | 諫早高附属 | 6:05.78 | |
| 20 | 838 | ワタナベ ユウキ 渡辺 夕煌 (1) | 喜々津 | 6:08.17 |