| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 322 | モモタ コウキ 百田 好希 (3) | 西諫早 | 4:08.92 | |
| 2 | 323 | ハシモト トラノスケ 橋本虎之介 (3) | 西諫早 | 4:09.08 | |
| 3 | 155 | サナカ ケンセイ 佐仲 健生 (3) | 諫早高附属 | 4:23.05 | |
| 4 | 209 | ミゾカミ タカト 溝上 鳳斗 (3) | 森山 | 4:23.52 | |
| 5 | 321 | サワセ ユウヒ 澤勢 夕陽 (3) | 西諫早 | 4:27.12 | |
| 6 | 676 | ミズカミ カナタ 水上 叶太 (3) | 高来 | 4:28.42 | |
| 7 | 262 | トミオカ シュウセイ 冨岡 柊誠 (3) | 諫早 | 4:30.55 | |
| 8 | 337 | ハマダ ユウガ 濱田 結雅 (3) | 長田 | 4:33.01 | |
| 9 | 223 | マエソノ コウキ 前園 幸希 (3) | 明峰 | 4:34.63 | |
| 10 | 324 | ツジノ テンマ 辻󠄀野 天雅 (3) | 西諫早 | 4:38.47 | |
| 11 | 686 | ヨシモト テルマ 吉本 瑛真 (3) | 高来 | 4:42.64 | |
| 12 | 504 | ツツミ ハルト 堤 悠人 (3) | 小長井 | 4:42.97 | |
| 13 | 156 | ナミト ケンタ 波戸 健太 (3) | 諫早高附属 | 4:44.38 | |
| 14 | 506 | タグチ ユウガ 田口 優雅 (3) | 小長井 | 4:46.24 | |
| 15 | 474 | オカ シュンヤ 岡 峻也 (3) | 真城 | 4:46.26 | |
| 16 | 269 | イワタ ヒロト 岩田 紘翔 (3) | 諫早 | 4:48.04 | |
| 17 | 658 | タサキ シュウタ 田﨑 修太 (3) | 北諫早 | 4:50.03 | |
| 18 | 164 | キタハラ ユウジン 北原 悠仁 (3) | 諫早高附属 | 4:51.33 | |
| 19 | 207 | サカグチ ユイト 坂口 結人 (3) | 森山 | 4:51.70 | |
| 20 | 338 | マツオ コウセイ 松尾 晄成 (3) | 長田 | 4:53.88 | |
| 21 | 165 | フキモト ルシン 葺本 琉心 (3) | 諫早高附属 | 4:57.71 | |
| 22 | 107 | ハシモト ハヤト 橋本 隼 (3) | 琴海 | 4:58.53 | |
| 23 | 208 | キシカワ シュンスケ 岸川 俊輔 (3) | 森山 | 6:00.51 |