| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 787 | フジヤマ ノゾム 藤山 希 (1) | 喜々津 | 4:40.12 | |
| 2 | 783 | マツモト ソウ 松本 双 (1) | 小長井 | 4:44.64 | |
| 3 | 788 | コバヤシ ハルト 小林 陽仁 (1) | 喜々津 | 4:45.38 | |
| 4 | 752 | カワイ シュウユ 川井 秀勇 (1) | 諫早高附属 | 4:46.87 | |
| 5 | 1034 | キノシタ ハルト 木下 陽翔 (1) | 西諫早 | 4:53.70 | |
| 6 | 782 | マツモト イチ 松本 壱 (1) | 小長井 | 5:02.68 | |
| 7 | 754 | ワタナベ ソウイチロウ 渡邉聡一朗 (1) | 諫早高附属 | 5:07.65 | |
| 8 | 989 | ヨコオ エイシン 横尾 榮心 (1) | 小野 | 5:11.71 | |
| 9 | 980 | タナカ シュウマ 田中 秀磨 (1) | 明峰 | 5:16.63 | |
| 10 | 1033 | ホリタ ヒロト 堀田 大翔 (1) | 西諫早 | 5:17.28 | |
| 11 | 1016 | ハヤシダ コウスケ 林田 煌介 (1) | 有喜 | 5:17.80 | |
| 12 | 1032 | モリ イッシン 森 一心 (1) | 西諫早 | 5:17.86 | |
| 13 | 1129 | タハラ ユウスケ 田原 友輔 (1) | 諫早 | 5:18.35 | |
| 14 | 921 | イケダ アオイ 池田 碧泉 (1) | 北諫早 | 5:27.64 | |
| 15 | 1132 | ノグチ シンイチロウ 野口慎一郎 (1) | 長崎日大 | 5:35.12 | |
| 16 | 1047 | ヤマダ リュウト 山田 竜登 (1) | 高来 | 5:38.68 | |
| 17 | 923 | ウノ フウマ 宇野 楓麻 (1) | 北諫早 | 5:41.50 | |
| 18 | 791 | タカマ リュウイチ 髙間 龍一 (1) | 喜々津 | 5:42.49 | |
| 19 | 1234 | コジマ シュンセイ 小島 舜世 (1) | 小野 | 5:47.06 | |
| 20 | 1046 | ナカツジ ミキヒト 中辻󠄀 幹人 (1) | 高来 | 5:47.35 | |
| 21 | 990 | モロクマ タクマ 諸熊 拓真 (1) | 小野 | 5:47.90 |