| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 132 | ドナイ ショウタ 土内 正汰 (2) | 福田 | 9:50.27 | |
| 2 | 33 | デグチ ジョウ 出口 丈 (3) | 長崎大附属 | 9:53.39 | |
| 3 | 52 | コヤナギ アオシ 小栁 葵獅 (2) | 長崎大附属 | 10:06.29 | |
| 4 | 314 | ヤマグチ ヒョウセイ 山口 彪星 (2) | 東長崎 | 10:06.34 | |
| 5 | 385 | ウラタ イップウ 浦田 一風 (2) | 三重 | 10:19.98 | |
| 6 | 774 | キノシタ トモロウ 木下 友郎 (1) | 長崎大附属 | 10:30.74 | |
| 7 | 53 | マトノ カンタ 的野 勘汰 (2) | 長崎大附属 | 10:33.89 | |
| 8 | 109 | タニグチ リョウスケ 谷口 椋亮 (3) | 緑が丘 | 10:38.72 | |
| 9 | 591 | マキグチ ケント 牧口 健人 (2) | 青雲 | 10:42.91 | |
| 10 | 51 | イトウ ソウシ 伊藤 颯志 (2) | 長崎大附属 | 10:45.69 | |
| 11 | 1279 | オオサワ ナオ 大澤 直生 (2) | 青雲 | 10:46.00 | |
| 12 | 1146 | タケシタ リョウ 竹下 諒 (2) | 岩屋 | 10:46.42 | |
| 13 | 55 | サカモト スイショウ 坂本 水晶 (2) | 長崎大附属 | 10:46.92 | |
| 14 | 588 | ホリオ ユウヤ 堀尾 侑乎 (2) | 青雲 | 10:56.29 | |
| 15 | 779 | ヒラノ ホタロウ 平野穂太朗 (1) | 長崎大附属 | 10:57.24 | |
| 16 | 43 | ミナワ チヒロ 三縄 千洋 (2) | 長崎大附属 | 11:04.66 | |
| 17 | 592 | ヤツシロ ハルキ 八代 大煌 (2) | 青雲 | 11:05.90 | |
| 18 | 500 | ウチダ リュウシン 内田 琉心 (2) | 長崎東 | 11:06.01 | |
| 19 | 311 | ワタナベ シュント 渡邉 俊斗 (2) | 東長崎 | 11:07.08 | |
| 20 | 1091 | ドイ トモキ 土井 智輝 (1) | 西浦上 | 11:09.57 | |
| 21 | 640 | ウラ コドウ 浦 琥道 (2) | 西彼 | 11:19.77 | |
| 22 | 1288 | オカムラ リョウスケ 岡村 亮介 (2) | 青雲 | 11:32.78 | |
| 23 | 902 | マツオ リュウビ 松尾 龍飛 (1) | 長崎 | 11:42.37 | |
| 24 | 426 | フクダ サネユキ 福田 真之 (2) | 長崎 | 11:48.75 | |
| 25 | 811 | スギヤマ リク 杉山 陸 (1) | 長崎東 | 11:56.36 | |
| 26 | 54 | オオクボ ライト 大久保頼人 (2) | 長崎大附属 | 12:33.23 | |
| 27 | 814 | マツオ タイチ 松尾 泰知 (1) | 長崎東 | 12:43.77 |