| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2114 | オリタ ミノル 折田 実 | 諫早中 | 15:45.57 | |
| 2 | 427 | ヨシヅ ケイゴ 吉津 圭悟 (1) | 創成館 | 15:45.84 | |
| 3 | 413 | ヨコタ リク 横田 陸 (2) | 創成館 | 15:46.07 | |
| 4 | 414 | ナガオカ コウタ 長岡 洸太 (2) | 創成館 | 15:56.73 | |
| 5 | 2156 | マツオ リク 松尾 玲玖 | 長大医学部 | 15:58.43 | |
| 6 | 2182 | オザキ カズシ 尾﨑 和志 (3) | Victoire | 16:31.97 | |
| 7 | 2559 | ヒラモト リュウガ 平本 龍雅 (3) | Victoire | 16:34.08 | |
| 8 | 2493 | モリタ ウミ 森田 海 (3) | Victoire | 16:34.74 | |
| 9 | 90 | キヤ カイト 木谷 海仁 (3) | 長崎大附属中 | 16:42.97 | |
| 10 | 423 | スガ ユウダイ 菅 侑大 (1) | 創成館 | 16:51.34 | |
| 11 | 412 | シバハラ シュウト 柴原 秀斗 (2) | 創成館 | 16:51.78 | |
| 12 | 421 | コジマ タイセイ 小島 大征 (1) | 創成館 | 16:52.02 | |
| 13 | 420 | ハヤシ セイヤ 林 政陽 (2) | 創成館 | 16:52.13 | |
| 14 | 418 | ナツイ コウダイ 夏井 航大 (2) | 創成館 | 17:00.45 | |
| 15 | 2158 | ソノダ シゲユキ 園田 繁之 | 長大医学部 | 17:11.42 | |
| 16 | 2229 | モリモト ケンタロウ 森本健太郎 | 三菱重工RC | 17:15.84 | |
| 17 | 13 | ウラカミ ソウマ 浦上 颯真 (3) | 西海中 | 17:21.94 | |
| 18 | 415 | ヒラタ リツ 平田 吏翼 (2) | 創成館 | 17:31.31 | |
| 19 | 425 | ナカトオリ カズマ 中通 一馬 (1) | 創成館 | 17:45.27 |