| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 西彼陸友会 | 42:08 | |
| 2 | 雞知 | 42:13 | |
| 3 | 長崎大附属 | 42:44 | |
| 4 | 志佐 | 42:56 | |
| 5 | 明峰 | 43:04 | |
| 6 | STR | 43:25 | |
| 7 | 石田 | 43:32 | |
| 8 | 高来 | 43:56 | |
| 9 | 桜が原 | 44:05 | |
| 10 | 郡 | 44:34 | |
| 11 | 日宇 | 45:02 | |
| 12 | 広田 | 45:25 | |
| 13 | 西泊 | 45:37 | |
| 14 | 愛野 | 46:03 | |
| 15 | 深江 | 46:15 | |
| 16 | 岐宿 | 46:21 | |
| 17 | 波佐見 | 46:21 | |
| 18 | 島原第一 | 46:22 | |
| 19 | 芦辺 | 46:31 | |
| 20 | 富江 | 46:31 | |
| 21 | 平戸 | 47:00 | |
| 22 | 川棚 | 47:03 | |
| 23 | 小浜 | 47:03 | |
| 24 | 上五島 | 47:43 | |
| 25 | 厳原 | 47:49 | |
| 26 | 有川 | 47:54 | |
| 27 | 有明 | 48:02 | |
| 28 | 御厨 | 48:18 | |
| 29 | 南部 | 48:54 | |
| 30 | 大崎 | 49:17 | |
| 31 | 北有馬 | 49:44 | |
| 32 | 西海 | 51:22 |