| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 787 | フジヤマ ノゾム 藤山 希 (1) | 喜々津 | 4:42.57 | |
| 2 | 752 | カワイ シュウユ 川井 秀勇 (1) | 諫早高附属 | 4:55.43 | |
| 3 | 783 | マツモト ソウ 松本 双 (1) | 小長井 | 5:03.99 | |
| 4 | 782 | マツモト イチ 松本 壱 (1) | 小長井 | 5:07.56 | |
| 5 | 1034 | キノシタ ハルト 木下 陽翔 (1) | 西諫早 | 5:11.87 | |
| 6 | 788 | コバヤシ ハルト 小林 陽仁 (1) | 喜々津 | 5:17.16 | |
| 7 | 1064 | モリグチ ヒカル 森口 陽翔 (1) | 琴海 | 5:23.75 | |
| 8 | 922 | クサノ ソラ 草野 蒼空 (1) | 北諫早 | 5:24.75 | |
| 9 | 921 | イケダ アオイ 池田 碧泉 (1) | 北諫早 | 5:26.21 | |
| 10 | 1033 | ホリタ ヒロト 堀田 大翔 (1) | 西諫早 | 5:30.85 | |
| 11 | 1126 | カワナミ オリト 川浪 織斗 (1) | 諫早 | 5:36.62 | |
| 12 | 1032 | モリ イッシン 森 一心 (1) | 西諫早 | 5:40.32 | |
| 13 | 1129 | タハラ ユウスケ 田原 友輔 (1) | 諫早 | 5:51.46 | |
| 14 | 1046 | ナカツジ ミキヒト 中辻󠄀 幹人 (1) | 高来 | 5:58.54 | |
| 15 | 1065 | マツオ アユム 松尾 歩夢 (1) | 琴海 | 6:03.30 | |
| 16 | 791 | タカマ リュウイチ 髙間 龍一 (1) | 喜々津 | 6:04.36 | |
| 17 | 1132 | ノグチ シンイチロウ 野口慎一郎 (1) | 長崎日大 | 6:07.48 |