| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 1:01:18 | |
| 2 | 東長崎 | 1:01:27 | |
| 3 | 桜馬場 | 1:01:37 | |
| 4 | 緑が丘 | 1:01:40 | |
| 5 | 三和 | 1:02:34 | |
| 6 | 西泊 | 1:03:05 | |
| 7 | 三重 | 1:03:05 | |
| 8 | 福田 | 1:04:13 | |
| 9 | 滑石 | 1:04:14 | |
| 10 | 岩屋 | 1:04:26 | |
| 11 | 梅香崎 | 1:04:39 | |
| 12 | 小島 | 1:04:53 | |
| 13 | 西浦上 | 1:05:37 | |
| 14 | 山里 | 1:05:38 | |
| 15 | 片淵 | 1:05:38 | |
| 16 | 香焼 | 1:05:42 | |
| 17 | 長崎東 | 1:06:00 | |
| 18 | 淵 | 1:06:42 | |
| 19 | 日見 | 1:07:02 | |
| 20 | 深堀 | 1:07:19 | |
| 21 | 橘 | 1:07:22 | |
| 22 | 土井首 | 1:08:14 | |
| 23 | 戸町 | 1:08:17 | |
| 24 | 野母崎 | 1:08:43 | |
| 25 | 小江原 | 1:08:46 | |
| 26 | 琴海 | 1:08:47 | |
| 27 | 大浦 | 1:09:49 | |
| 28 | 横尾 | 1:09:54 | |
| 29 | 小ヶ倉 | 1:09:59 | |
| 30 | 三川 | 1:10:02 | |
| 31 | 茂木 | 1:10:17 |