| 順位 | チーム名 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 1 | 長崎大附属 | 43:54 | |
| 2 | 西泊 | 45:28 | |
| 3 | 岩屋 | 46:08 | |
| 4 | 琴海 | 46:09 | |
| 5 | 桜馬場 | 46:32 | |
| 6 | 滑石 | 46:43 | |
| 7 | 山里 | 46:55 | |
| 8 | 東長崎 | 47:20 | |
| 9 | 三重 | 48:16 | |
| 10 | 戸町 | 48:24 | |
| 11 | 橘 | 48:28 | |
| 12 | 大浦 | 48:39 | |
| 13 | 三和 | 48:46 | |
| 14 | 長崎東 | 49:04 | |
| 15 | 緑が丘 | 49:05 | |
| 16 | 西浦上 | 49:48 | |
| 17 | 日見 | 49:50 | |
| 18 | 福田 | 50:22 | |
| 19 | 梅香崎 | 50:26 | |
| 20 | 小島 | 50:28 | |
| 21 | 深堀 | 50:29 | |
| 22 | 淵 | 51:30 | |
| 23 | 土井首 | 51:59 | |
| 24 | 小ヶ倉 | 52:49 | |
| 25 | 香焼 | 54:30 |