| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2031 | ヨコヤマ キホ 横山 希歩 (2) | 西彼陸友会 | 4:53.53 | |
| 2 | 43 | ジンカワ マオ 陣川 真緒 (3) | 長崎大附属 | 4:56.35 | |
| 3 | 2035 | ヨシダ アキ 吉田 愛希 (1) | 西彼陸友会 | 5:03.28 | |
| 4 | 42 | ハラ クルミ 原 胡桃 (3) | 長崎大附属 | 5:04.79 | |
| 5 | 45 | ヒラガ サエ 平賀 紗英 (1) | 長崎大附属 | 5:12.08 | |
| 6 | 2033 | ヨシノ サキネ 吉野 咲音 (2) | 西彼陸友会 | 5:12.48 | |
| 7 | 319 | クサノ アイラ 草野 愛羅 (3) | 長崎日大 | 5:14.19 | |
| 8 | 2032 | ヤマグチ リリコ 山口璃々子 (2) | 西彼陸友会 | 5:14.63 | |
| 9 | 2067 | ナカシマ ミユ 中嶋 心優 (2) | STR | 5:16.00 | |
| 10 | 388 | ナガイ リリア 長井 鈴愛 (3) | 長崎琴海 | 5:18.96 | |
| 11 | 2070 | コモリ ヒカリ 小森 光莉 (2) | STR | 5:19.93 | |
| 12 | 28 | マツモト アコ 松本 亜子 (3) | 東長崎 | 5:20.13 | |
| 13 | 44 | ツツイ ミウ 筒井 美羽 (3) | 長崎大附属 | 5:21.85 | |
| 14 | 279 | キタノ リア 北野 莉彩 (2) | 桜が原 | 5:34.96 | |
| 15 | 285 | テライ リンカ 寺井 鈴夏 (3) | 長崎東 | 5:42.00 | |
| 16 | 2073 | ヤスナガ セイナ 安永 成那 (2) | STR | 5:43.73 | |
| 17 | 286 | ノグチ フウカ 野口 楓夏 (2) | 長崎東 | 5:50.25 | |
| 18 | 2068 | フカホリ ヒナ 深堀 陽菜 (2) | STR | 5:50.65 | |
| 19 | 272 | ツジカワ ハルヒ 辻󠄀川 陽日 (3) | 桜が原 | 5:51.83 | |
| 20 | 205 | ムラキ ヒイロ 村木ひいろ (2) | 西浦上 | 5:52.46 | |
| 21 | 2065 | オサキ ヒナタ 尾﨑 陽向 (2) | STR | 5:54.68 |