| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2290 | ナルセ ナツキ 鳴瀬 夏輝 (3) | 西彼陸友会 | 9:19.59 | |
| 2 | 52 | コヤナギ アオシ 小栁 葵獅 (2) | 長崎大附属 | 9:26.90 | |
| 3 | 2060 | アオキ シンタロウ 青木信太朗 (2) | 西彼陸友会 | 9:30.27 | |
| 4 | 1311 | ヤマグチ モンジロウ 山口紋治郎 (3) | 諫早 | 9:40.63 | |
| 5 | 1179 | サカモト コウスケ 坂本 光祐 (2) | 鳴北 | 9:41.85 | |
| 6 | 347 | ミゾタ ケンゴ 溝田 健吾 (2) | 諫早 | 9:42.79 | |
| 7 | 2062 | ドナイ ショウタ 土内 正汰 (2) | Victoire | 9:49.51 | |
| 8 | 2061 | ヨコヤマ ユウタ 横山 勇太 (2) | 西彼陸友会 | 9:53.16 | |
| 9 | 475 | ナカシマ ユウト 中島 悠斗 (2) | 時津 | 9:53.29 | |
| 10 | 774 | キノシタ トモロウ 木下 友郎 (1) | 長崎大附属 | 9:58.80 | |
| 11 | 314 | ヤマグチ ヒョウセイ 山口 彪星 (2) | 東長崎 | 9:59.77 | |
| 12 | 672 | アライ リョウタ 新井 亮太 (3) | 大瀬戸 | 10:05.05 | |
| 13 | 53 | マトノ カンタ 的野 勘汰 (2) | 長崎大附属 | 10:15.18 | |
| 14 | 1199 | ワタナベ アサヒ 渡邉 朝日 (1) | 時津 | 10:17.24 | |
| 15 | 546 | ヒサマツ イツキ 久松 樹生 (2) | 鳴北 | 10:18.68 | |
| 16 | 1177 | ヨシダ レイ 吉田 玲唯 (1) | 鳴北 | 10:22.55 | |
| 17 | 319 | ミネ リュウト 峯 琉斗 (2) | 東長崎 | 10:26.99 | |
| 18 | 969 | モリタ ハルマ 森田 晴真 (1) | 東長崎 | 10:27.54 | |
| 19 | 51 | イトウ ソウシ 伊藤 颯志 (2) | 長崎大附属 | 10:34.06 | |
| 20 | 479 | ヤマモト ユイト 山本 結翔 (2) | 時津 | 10:37.22 | |
| 21 | 1091 | ドイ トモキ 土井 智輝 (1) | 西浦上 | 10:40.70 | |
| 22 | 1089 | カワグチ ヒカル 川口 輝 (1) | 西浦上 | 10:40.74 | |
| 23 | 1174 | コサザ レン 小佐々 廉 (1) | 鳴北 | 10:50.93 | |
| 24 | 43 | ミナワ チヒロ 三縄 千洋 (2) | 長崎大附属 | 10:52.13 | |
| 25 | 1314 | ミヤムラ ユウセイ 宮村 優誠 (1) | 大瀬戸 | 11:07.62 | |
| 26 | 545 | ヤマシタ ショウタロウ 山下翔大朗 (2) | 鳴北 | 11:13.24 | |
| 27 | 1172 | アライ ハルキ 新井 陽希 (1) | 鳴北 | 11:13.24 | |
| 28 | 779 | ヒラノ ホタロウ 平野穂太朗 (1) | 長崎大附属 | 11:15.34 | |
| 29 | 1198 | イリエ リョウタ 入江 遼太 (1) | 時津 | 11:16.31 | |
| 30 | 1129 | タハラ ユウスケ 田原 友輔 (1) | 諫早 | 11:24.59 | |
| 31 | 311 | ワタナベ シュント 渡邉 俊斗 (2) | 東長崎 | 11:40.51 | |
| 32 | 971 | スエマツ リク 末松 陸 (1) | 東長崎 | 12:08.46 |