| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1003 | マエノ リュウシン 前野 琉芯 (1) | 諫早 | 4:32.49 | NGR |
| 2 | 1007 | ヨネミツ タカハル 米満 飛晴 (1) | 諫早 | 4:47.30 | |
| 3 | 1111 | ホンダ ユウマ 本田 雄真 (1) | 高来 | 4:54.21 | |
| 4 | 937 | ヒガシウチ ショウタロウ 東内将太郎 (1) | 西諫早 | 5:06.49 | |
| 5 | 879 | ナカオ ユキヒロ 中尾 幸弘 (1) | 諫早高附属 | 5:06.77 | |
| 6 | 935 | ダイモン コウセイ 大門 幸世 (1) | 西諫早 | 5:07.03 | |
| 7 | 1094 | タナカ ジン 田中 迅 (1) | 長崎日大 | 5:14.11 | |
| 8 | 1030 | ノムラ シュウマ 野村 秋馬 (1) | 高来 | 5:15.42 | |
| 9 | 969 | モトムラ リュウタ 元村 龍太 (1) | 喜々津 | 5:19.22 | |
| 10 | 1029 | スギノ アラタ 杉野 新 (1) | 高来 | 5:20.06 | |
| 11 | 974 | ヨシダ ヒロト 吉田 大翔 (1) | 喜々津 | 5:20.74 | |
| 12 | 939 | モトオ フクナリ 元尾 福成 (1) | 西諫早 | 5:31.78 | |
| 13 | 123 | ナカザト リョウマ 中里 龍誠 (1) | 小長井 | 5:34.22 | |
| 14 | 885 | ツチバシ マヒロ 土橋 真博 (1) | 森山 | 5:37.50 | |
| 15 | 978 | シラキ リュウト 白木 龍翔 (1) | 喜々津 | 5:46.11 | |
| 16 | 976 | ソノダ コウタロウ 其田航太朗 (1) | 喜々津 | 6:03.02 | |
| 17 | 1134 | コバヤシ ライキ 小林 來輝 (1) | 琴海 | 6:08.36 | |
| 18 | 1056 | タサキ セイマ 田﨑 晟真 (1) | 小野 | 6:10.60 | |
| 19 | 1135 | シミズ カイシン 清水 快親 (1) | 琴海 | 6:17.81 | |
| 20 | 1136 | ヤマウチ ゲンジ 山内 源士 (1) | 琴海 | 6:20.68 | |
| 21 | 1052 | ヤマモト ヒロト 山本 大翔 (1) | 小野 | 6:23.22 | |
| 22 | 1055 | シミズ ハジメ 清水 元 (1) | 小野 | 6:54.63 |