| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1270 | ヤマナカ ミナト 山中 湊翔 (3) | 東長崎 | 9:18.17 | |
| 2 | 2019 | ワシオ ケンスケ 鷲尾 健介 (3) | Victoire | 9:25.45 | |
| 3 | 282 | ドイ トモキ 土井 智輝 (2) | 西浦上 | 9:29.31 | |
| 4 | 64 | キノシタ トモロウ 木下 友郎 (2) | 長崎大附属 | 9:33.67 | |
| 5 | 2174 | ドナイ ショウタ 土内 正汰 (3) | Victoire | 9:34.89 | |
| 6 | 2140 | アオキ シンタロウ 青木信太朗 (3) | 西彼陸友会 | 9:39.65 | |
| 7 | 2292 | ホリヤマ コウキ 堀山 幸暉 (2) | 西彼陸友会 | 9:43.14 | |
| 8 | 42 | モリタ ハルマ 森田 晴真 (2) | 東長崎 | 9:52.18 | |
| 9 | 279 | カワグチ ヒカル 川口 輝 (2) | 西浦上 | 9:53.09 | |
| 10 | 541 | ミズモト コウタ 水本 航太 (3) | 大瀬戸 | 9:57.04 | |
| 11 | 86 | ヒラノ ホタロウ 平野穂太朗 (2) | 長崎大附属 | 10:06.88 | |
| 12 | 540 | カシワギ コウタ 柏木 航太 (3) | 大瀬戸 | 10:16.06 | |
| 13 | 53 | コンドウ マサムネ 近藤 潤心 (3) | 東長崎 | 10:17.58 | |
| 14 | 2105 | タガミ ミナト 田上 湊 (2) | Victoire | 10:23.14 | |
| 15 | 2109 | ドナイ ヒロト 土内 寛人 (1) | Victoire | 10:34.88 | |
| 16 | 2114 | タクミョウ ソワ 宅明 湊笑 (1) | 南部AC | 10:38.14 | |
| 17 | 473 | コダマ ユウリ 小玉 侑利 (2) | 三重 | 10:38.16 | |
| 18 | 539 | ミヤムラ ユウセイ 宮村 優誠 (2) | 大瀬戸 | 10:44.07 | |
| 19 | 1082 | ヤマナカ ハルト 山中 陽翔 (1) | 長崎大附属 | 10:44.80 | |
| 20 | 2106 | サトウ ハクト 佐藤 珀斗 (2) | Victoire | 10:45.72 | |
| 21 | 2112 | イノウエ ミツアキ 井上 光昭 (1) | 南部AC | 10:51.45 | |
| 22 | 1057 | アソウ カケル 麻生 翔琉 (1) | 三重 | 10:52.62 | |
| 23 | 1096 | ヤマグチ ケイタ 山口 慧大 (1) | 戸町 | 10:58.79 | |
| 24 | 52 | ヤマグチ ヒョウセイ 山口 彪星 (3) | 東長崎 | 11:00.78 | |
| 25 | 2116 | モガリ ソウタ 茂刈 蒼大 (1) | 南部AC | 11:05.07 | |
| 26 | 44 | スエマツ リク 末松 陸 (2) | 東長崎 | 11:05.17 | |
| 27 | 1247 | ハマダ トモヒロ 濵田 智皓 (1) | 西海 | 11:06.34 | |
| 28 | 1148 | タケミヤ ケイジ 武宮 敬志 (1) | 大瀬戸 | 11:09.10 | |
| 29 | 919 | ヤマシタ シュンキ 山下 俊輝 (2) | 西浦上 | 11:11.98 | |
| 30 | 1097 | ヤマグチ リュウセイ 山口 竜世 (1) | 戸町 | 11:26.72 | |
| 31 | 1081 | カネコ シュウヤ 金子 修也 (1) | 長崎大附属 | 11:26.97 | |
| 32 | 1158 | ミネ アオト 峰 碧斗 (1) | 長与第二 | 11:39.00 | |
| 33 | 266 | ハベ ツカサ 羽辺 束早 (2) | 戸町 | 12:57.89 |