| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 682 | フクナガ ダイゴ 福永 大悟 (1) | 諫早高附属 | 4:43.58 | |
| 2 | 3013 | ナカムラ アイキ 中村 愛輝 (1) | 真城 | 4:45.17 | |
| 3 | 3007 | ササキ セイタロウ 佐々木誠太朗(1) | 有喜 | 4:52.44 | |
| 4 | 790 | キムラ ユウト 木村 悠人 (1) | 諫早 | 4:53.42 | |
| 5 | 794 | オカモト マモル 岡本 遵 (1) | 諫早 | 4:56.59 | |
| 6 | 1003 | マツオ ナツキ 松尾 夏希 (1) | 明峰 | 4:59.45 | |
| 7 | 801 | ウラ コウキ 浦 航毅 (1) | 西諫早 | 5:00.22 | |
| 8 | 787 | タグチ レオ 田口 怜旺 (1) | 諫早 | 5:00.57 | |
| 9 | 687 | ナカシマ タケル 中島 丈 (1) | 諫早高附属 | 5:01.49 | |
| 10 | 646 | マエダ カイシン 前田 海芯 (1) | 長田 | 5:13.80 | |
| 11 | 737 | ハヤシ ルキ 林 琉毅 (1) | 高来 | 5:14.20 | |
| 12 | 786 | カマモト シュンカイ 釜元 駿佳 (1) | 諫早 | 5:29.78 | |
| 13 | 829 | ワダ アツト 和田 篤人 (1) | 北諫早 | 5:40.18 | |
| 14 | 3001 | ムカイ ソウゴ 向井 颯吾 (1) | 飯盛 | 5:47.52 | |
| 15 | 686 | フジワラ ユウト 藤原 悠人 (1) | 諫早高附属 | 5:48.99 | |
| 16 | 827 | ミゾカミ カズキ 溝上 和樹 (1) | 北諫早 | 5:55.90 | |
| 820 | クボタ カズマ 久保田和真 (1) | 小長井 | 6:01.96 | OPN *NS |